DPARSFA error calculating ALFF and fALFF

Submitted by tara.fd on

Hi experts

I get the following errors while I try running DPARSFA tu calculate fALFF+ALFF on the server:

Error using rest_spm_read_vols (line 34)

file too small.

Error in rest_ReadNiftiImage (line 110)

Data = rest_spm_read_vols(V);

Error in rest_readfile (line 71)

[Outdata,Header] = rest_ReadNiftiImage(hname,volumeIndex);

Error in rest_to4d (line 103)

[theOneNiiFileTimePoint, VoxelSize, Header] = rest_readfile(theFilename, 'all');

Error in y_alff_falff (line 54)

DPABISurf报错(在DPABI5.0/5.1下)

Submitted by wpf1027 on

严老师和各位老师们好!

我在linux下使用DPABISurf会在fmriprep那一步就报错,我跑的是DemoData,系统是Ubuntu1804LTS(运行在虚拟机下),matlab是2014B,docker版本与dpabi版本对应(比如5.1就用5.1的docker,我会把虚拟机还原,不会有其它版本的docker)。

之前用DPABI_V4.3_200401,所有功能一切正常。换成5.0和5.1,matlab都会在启动dpabi的时候出现黄色警告,内容见error1.txt,然后在跑DPABISurf的时候会在fmriprep那一步就报错(Error detected during running fmriprep),内容见error2。

dpabi crash

Submitted by jeanne_yang on

严老师您好!

   向您请教一个问题,我用运行着docker的windows 10专业版系统,用基于matlab的dpabi,用网站上下载的练习dpabisurf的demo数据,按照dpabisurf的默认设置运算,跑了几次,都是出同样的问题:尽管matlab的窗口显示在忙,但工作文件的大小超过24小时没有变化,检查fmriprep/sub-Sub001/log文件下的crash,内容如下(试跑了几次,报的都是这个内容):

 

DpabiSurf计算功能连接时定义ROI的问题

Submitted by Lee on

严老师以及各位老师,你们好。我在用DpabiSurf来跑被试者功能连接的时候遇到一个问题,之前用Dpabi计算FC的时候可以用Mask来定义ROI,这里的Mask是nii文件。那么现在我用DpabiSurf来计算FC的时候以前的Mask还适用吗?我看视频教程里面使用的Mask是gii格式的。如果需要使用gii格式的Mask,我应该去哪里获取呢?比如我想要计算海马与其他脑区的FC,我应该如何设置ROI。希望能得到你们的回答,非常感谢。