DPARSFA数据说明

DPARSFA大多数文件夹的组织方式为:工作路径\被试名\数据文件。

FunRaw:该文件夹下包含了所有被试扫描数据的DICOM文件。

FunImg:该文件夹下包含了所有被试的功能像NIFTI格式文件,一般情况下,这些文件由DPARSF中的“dcm2nii”功能自动生成。除非特别声明,以FunImg开头的文件夹下存储的都是NIFTI格式文件。

FunImgA:“A”表示时间层矫正。该文件夹下存储了去除前10个时间点并进行了时间层矫正的数据文件。

FunImgAR:“R”表示头动矫正。该文件夹下存储的是在FunImgA文件中数据的基础上进行了头动矫正后的数据文件。

FunImgARC:“C”表示噪声去除(不包括全局信号回归)。该文件夹下存储的是在FunImgAR文件中数据的基础上进行了噪声去除(不包括全局信号回归)后的数据文件。

FunImgARglobalC:“globalC”表示噪声去除(包括全局信号回归)。该文件夹下存储的是在FunImgAR文件中数据的基础上进行了噪声去除(包括全局信号回归)后的数据文件。

FunImgARCovs:存储了在噪声去除的过程中使用的线性回归模型中包含的协变量。

DPABI/DPABISurf/DPARSF Error Handling

DPABI/DPABISurf/DPARSF Error Handling

(中文版在后半部分)

DPABI/DPABISurf/DPARSF Stand-Alone Version

The R-fMRI Course

 

 

The R-fMRI Course V3.0 English Version

Dicom sorter能对nii格式文件整理吗

严老师您好,首先感谢您上次的解答,然后我看了下您的视频dpabi的dicom sorter能把数据整理成FunRaw和T1Raw,然后下面是sub_001被试编号,我从网上下的数据是4D的功能图像,结构T1也是nii文件,然后我dicom sorter出现图像下方的报错。

dpabisurf跑完后产生您说的不应该存在的log文件

尊敬的严老师,您好!

       最近我在使用dpabisurf分析您提供的demo数据的时候,全部跑完中间也没用报错,但是我对照您的视频上说fmriprep这个目录下sub-Sub001这个目录下不应该有log这个目录,但是我跑完之后有这个目录,打开下面的文件内容如下,好像没有什么报错信息。文件名是fmriprep.toml(为了可以上传我改成了txt文件),感谢您在百忙之中抽空回复,谢谢您!

 

DPABISurf跑fmriprep报错

老师好,

        有个问题想请教下老师,我在跑fmriprep的时候,总是在Running Euler3DTransform registration的时候出现一些错误,不知道是什么问题,上传了一个报错的文档,并且有的被试能跑出来surface的文件,有的跑不出来,希望老师能帮忙看一下,谢谢crash-20230320-035209-root-norm-dc5c8537-f89d-43ab-9a4e-ac7b69f0ff9e.txt

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