ADNI数据预处理出现错误

Submitted by Czh on

严老师好:

我对ADNI上下载的原始dicom文件进行预处理,将其转为nii格式后出现两种状态,如下图所示,1:正常的为上方所示,2:异常的如下方所示,各voxel的值过大,造成后续预处理有问题,请问原因是什么?该如何解决?

谢谢老师

DPABISurf Pipeline 报错求助

Submitted by wangmin_CSU on
系统是Windows10 专业版,下载安装好了docker、证书,通过dpabi的utilities检查了数据格式没有错误,试运行能得到gii文件。正式从nii格式文件开始处理时报错。求助严老师,不知道是哪里出了错?具体报错如下:

关于DPARSF计算ROI-wise功能连接问题

Submitted by spl on

老师,您好,我想问一下我在使用DPARSF进行预处理及ALFF,ReHo以及FC等特征提取时是选择在所有特征计算完后进行smooth derivatives,这时候ROI-wise的FC的文件夹是ROIsignals_FunImgARCWF是基于没有进行平滑处理的数据计算的,请问这时候得到的ROI-wise的FC可以直接使用进行下一步分析么?还是说需要在预处理后的数据基础上再进行smooth后再计算ROI-wise的FC呢?

DPASF中cropT1的问题

Submitted by Olivia on

严老师你好,

我手上的T1像是只从dcm转了一步格式的nii文件,没有co和o开头的文件。所以想获得去了脖子co开头的结构像。我用cropT1来获得co和o开头的文件,但最后文件没有任何变化。还提示没有co文件,详见附件。

 

想请教严老师如何用仅转了格式的T1.nii文件来获得去脖子的文件。

谢谢严老师,祝好!

预处理过程报错求助

Submitted by doctorsu on

严老师,您好,我在处理静息态功能核磁数据时出现这样的报错,想请教您
Moving Slice Timing Corrected Files:sub001pro OK
{'Error in Slice Timing, time point number doesn't match: sub001pro'}

错误使用 copyfile
未找到匹配的文件。

出错 DPARSFA_RerunWithGSR (line 89)
copyfile([Cfg.DataProcessDir,filesep,FunSessionPrefixSet{iFunSession},StartingDirName],[Cfg.DataProcessDir,filesep,FunSessionPrefixSet{iFunSession},StartingDirName,'global']);