今天碰到的几个问题

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Taxonomy upgrade extras
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近期碰到几个问题
拿出来大家看看：

做统计分析结果呈现的时候，因为是手动配准，用的AFNI tlrc坐标，最终结果在各种工具中呈现结果不同：
rest slice viewer效果最好，与模板匹配




同样的结果放到MRIcroN就不匹配（我用的模板和mask是同源的）
可能是MNI坐标与tlrc坐标不同的关系





在spm里面也一样 不匹配：

dparsf潜在的bug?

Submitted by marvelancet on
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Taxonomy upgrade extras
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DPARSF
亲爱滴们：

今天碰到这样一个问题，焦头烂额：
由于这批数据需要手动配准，所以我的处理流程如下：
1. 用dparsf批处理至realign。
2.用spm做coregister.
3.用AFNI转换格式后做Normalize
4.转换个格式后，将得到的EPI相文件放入FunImgNormalized文件夹。
然后启动dparsf，
先跳过Smooth做的ReHo，很顺利，detrend, filter, reho...没有任何问题。
然后继续用dparsf做alff以及falff，操作过程如下：
    -matlab下输入dparsf
    -依次去掉smooth前所有的勾
    -选择工作目录
   - 输入时间点190
   - 选择自定义模板 

help 2: dparsf

Submitted by marvelancet on
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Taxonomy upgrade extras
DPARSF
hi,

the previous error i brought up was fixed by adding the line
    "rest_Fix_Read_Write_Error"
before initializing dparsf.

however, the time between pressing the bottom "run" and actual data precessing is much longer  in the linux environment than windows (just now i experienced a 15 min lag).
so is the time for data precessing.
what might the problem be? how can i fix it?
i'm currently using double systems on my laptop, which are windows XP and linux fedora ver 12.

help: dparsf error

Submitted by marvelancet on
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Linux, fedora 12
Matlab 2010a
Dparsf lastest ver.
spm8
error:

??? Error using ==> DPARSF('editSliceOrder_Callback',gcbo,[],guidata(gcbo))
Error: This statement is incomplete.

Error in ==> DPARSF>editSliceOrder_Callback at 369
    handles.Cfg.SliceTiming.SliceOrder =eval(['[',SliceOrder,']']);

Error in ==> gui_mainfcn at 96
        feval(varargin{:});

Error in ==> DPARSF at 39

左右脑位置

Submitted by sunshine on
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各位老师：
      现在我有一个关于左右脑的问题想向各位老师请教一下。附件中是一个mask，我把它命名为cacudate(L),因为用mricro打开叠加在CH2模板上显示的是左侧。想请问老师这个mask是不是就是对应在核磁机上打开看到的左侧，是真实人脑的右侧呢？
      非常感谢！

请教：REST DICOM sorter报错

Submitted by huchongyu1983 on
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dicom文件穿不上来，提示
 Only files with the following extensions are allowed: jpg jpeg gif png txt doc xls pdf ppt pps odt ods odp img hdr nifti nii.
我把dicom的文件重命名，后面加了后缀.jpg传上来，能帮我看看吗？
还有一个问题请教，关于slice view能不能也像xjview的volume一样，出一个表格，然后点表格内的坐标，图像的十字架就可以自动定位到坐标所在的位置？

运行DPARSF报错

Submitted by jo on
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隔了一阵子没有用DPARSF处理数据了,我用的是Matlab2008b, SPM8,DPARSF100510,原来一直都运行良好,但这次运行后出现以下报错. 换了不同的SPM8版本及DPARSF版本,都是一样的报告,根本不能运行,请求帮助!!!


 Undefined function or method 'cfg_util' for input arguments of type 'cell'.
Error in ==> spm_jobman at 206
cjob = cfg_util('initjob', mljob);
Error in ==> DPARSF_run at 318
spm_jobman('run',jobs{1});
Error in ==> DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 935
[Error]=DPARSF_run(handles.Cfg);
Error in ==> gui_mainfcn at 96
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