reslice

Submitted by insular on
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老师：
     您好。
     我用rest slice view看我的功能连接的结果，用了ch的underlay。但是发现ch的dimension和voxel size和我的功能像不匹配。
    然后我就想对ch.nii用rest进新reslice，但是好像rest只能处理img文件，不能出来nii文件。
    是不是我需要把我的功能结果reslice到和ch.nii一样？

用rest的two sample t test时的Warning

Submitted by insular on
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老师，您好。
    


Warning: There are too few time points.(i.e. The number of the time points is less than 10)

我做了某个ROI的voxel-vised的功能连接，得到zFCMAP，我对2组人的zFCMAP进行two-sample test，然后就出现了以上的Warning. zFCMAP好像不存在时间点这个概念吧。在算功能连接时，不是所有的时间序列的值都平均成一个值了么。





--------------
    Image Files in Group 1:
    zFCMap_lFFA_AD01_detrend_filtered_Covheadremoved.img
    zFCMap_lFFA_AD02_detrend_filtered_Covheadremoved.img

如果BOLD图像少了一幅还能够分析吗

Submitted by demonpupil on
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  老师们好：
  我们使用GE的机子扫描患者BOLD相，扫描240个时间点，33层一共应该有7920幅图像，但是有几个病人导出数据后只有7919幅图，这样能不能进行后序静息态数据处理呢，我用DPARSF跑这样的数据一跑一个错，有没有什么办法能够解决这个问题呢？
报错为：Converting 7919/7919  240
1.2.840.113619.2.244.6945.3202482.22429.1278821188.824.dcm->20100711_143045EPILEPSYF5RENQIANGs004a1001.img
Time elapsed 47594ms
Converting Functional Images:Sub_001 OK
??? Index exceeds matrix dimensions.

Error in ==> DPARSF_run at 274
            delete(DirImg(j).name);

normalize做完后 DPARSF报错

Submitted by demonpupil on
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各位老师好：

  我在用DPARSF进行数据处理过程中，在做完Normalize之后报错，报错内容如下：
Running "Normalise: Write"
--------------------------
Running "Normalise: Write"
Moving Normalized Files:Sub_001 OKMoving Normalized Files:Sub_002 OKMoving Normalized Files:Sub_003 OKMoving Normalized Files:Sub_004 OKMoving Normalized Files:Sub_006 OKMoving Normalized Files:Sub_008 OKMoving Normalized Files:Sub_009 OKMoving Normalized Files:Sub_010 OK
Warning: In the directory "F:\Softs\spm5", spm_bsplinc.mexw32 now shadows
spm_bsplinc.dll.

slice viewer 运行 CI report 时 报错，请帮忙

Submitted by homerzeng on
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各位老师，
      我在用REST 的UTILITY的 SLICE VIEWER ， 先设好的Cluster Size 的VOXEL为5，rmm为 4， 再点CI report 后 MATLAB 报错 如下
This report is based on CUI Xu's xjview. (http://www.alivelearn.net/xjview/)
Number of clusters found: 38
----------------------
Cluster 1
Number of voxels: 206505

左右脑显示问题

Submitted by sunshine on
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我将用SPM5处理得到的结果在Rest_slice Viewer中用Montage显示和在xjview中用slice view显示，出现了两种显示下左右脑刚好颠倒了，请问各位老师这是什么原因？Rest_slice Viewer不是参考xjview写的么？
另外，在SPM5中在uncorrect情况下设置p<0.05,对应的t阈值为1.8125，而在Rest_slice View中设置p<0.05,对应的threshold为2.2281。这又是为什么？

关于bounding box

Submitted by insular on
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老师，您好。

在听您录得教程时，提到过要修改bounding box，说是spm默认的bounding box太小，并提供了一个常用的bounding box的值。

如果我们要处理的数据不是成人，而是小孩，猴子，大鼠等等，我们的bounding box又应该设设多大呢？

我们如何评判bounding box设的合不合适？

bounding box的大小是否要根据voxel size的不同而改变？

麻烦老师了.

关于linear detrend

Submitted by insular on
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老师，您好。
我最近在用Rest处理一批静息态数据，其中的linear detrend这一项我有一些疑问。
我记得以前用普通方法做的时候，linear detrend要用到在relign时生成的参数文件。
为什么rest的linear detrend没有提示要选择参考什么文件？
而是默认的，我要把那个文件与我的图像放在一起？


谢谢
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