SPM看统计结果

Submitted by drpen on
Taxonomy upgrade extras

想请问老师几个比较基础的问题:
1、就是如上图的统计结果表格,各列都是什么意义(最后还差一列贴图没显示全,个人觉得应该是各个cluster的峰值点的坐标);
2、Z值是什么意思,如何求得;
3、现在能够知道激活的cluser在各个脑区的像素是多少,是否还能求激活的强度呢。谢谢

Rest的坐标改变

Submitted by insular on
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老师,您好 用Rest做fC,我遇到坐标问题,得出的结果图像与原始图像以及mask不一致(x坐标上有位移,并且x轴上的起始坐标不一致)。 如下: restFMRI_1 是处理好的fmri数据。我用rest做ROI Center(mm)=(-5.500000e+00, -31, 1.150000e+01); Radius=1.50 mm, 与全脑的功能连接 mask 全脑的mask FCMaps_result 得到的结果。 可以看到,restFMRI_1 和 mask 的坐标以及原点是一致的,可是得到的FCMaps在x坐标上有位移,并且x轴上的起始坐标不一致。 这是怎么导致的,有没有办法解决。 另外,对于我定义的ROI,Rest在计算时,会不会四舍五入,把ROI变成 (-6,-31,12); R=2mm ???

fix-effect and mix-effect

Submitted by insular on
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各位老师,新年快乐。 对于rest统计我有一个疑问: 假设我有10个被试,每个被试有6个session的resting fmri,每个session是5分钟的扫描。 现在我用PCC做ROI与全脑做功能连接,于是就会得到 10个被试*6个session = 60个 zFCMaps. 现在我想看PCC与哪些区域有显著的功能连接,我是不是可以直接拿这60个zFCMaps做one sample t test? --- 但是我看一些文献,好像在统计做了区分(不知道我理解对不对): fix-effect -- 由每个人的6个session的zFCMaps来得到每个人的map, 这样60个zFCMaps就变成了10个maps ????这个过程不需要由样本推测总体?? mix-effect -- 由每个人的maps得到总体的maps,这样10个maps就变成了我想要的一个map ??? 这个过程是由样本推测总体 ,所以在统计时的一些参数和上面不一样?? 这个概念我一直不是很清楚,我一直就是用rest的one sample t test来处理,没分什么fix-effect和mix-effect。

咨询

Submitted by natalia on
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严老师:
       您好。我根据您的视频做了三个正常人的REHO及ALFF,顺便试着做了个单样本t检验,得出的图像出现了蓝色的激活区,而且在脑室里也有激活的存在。现在的问题是1、为什么会出现负激活,这个要怎么解释?2、脑室出现激活,是因为我的病例数太少,统计学误差还是因为在数据处理过程中有问题?谢谢您。

VBM看结果时报错

Submitted by drpen on
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老师您好,请问,我按照在您实验室学习班的方法处理VBM后,想用rest的slice viewer来看结果,特别要用其中整合的xjview看report,但选择打开处理后的SpmT后,总是报“this NifTi image includes an rotation transformation.You should reslice this data before attempting to overlay the image.” VBM中怎么再做reslice?我按照Dartel-Vbm操作流程处理的,没看到有单独再做reslice啊?

7.0T MRI分析

Submitted by wd850103 on
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严老师您好:
      先前咨询您答复说rest可以用于7.0t 大鼠的脑静息态数据的分析。 我们大鼠的模板是由中科院高能物理所开发的,他们认为用rest分析鼠脑的数据要做一定的修改。因为为医学背景,比较困惑。能不能简单告之原因?谢谢。

请问这个问题怎么解决??定义种子点用不了

Submitted by lihong on
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严老师:
      你好,我在用Spherical ROI来做感兴趣的时候,用view ROI来看我的种子点的时候,选取了ch2模板,但是matlab提示出现问题以下问题,而且我直接做FC的时候也出现了这个问题。请问怎么样解决?
Exception occured. (MATLAB:COPYFILE:OSError)
 Error using ==> copyfile
另一个程序正在使用此文件,进程无法访问。