i followed the instruction of Doc. yan_DPABISurf Installation on Windows | The R-fMRI Network (rfmri.org)

when i finally test the dpabisurf processing by running utilities as the instruction, matlab returns:

docker : invalid reference format. 

see "docker run --help"

besides, there is no report of error during the whole process of installation. 

can anyone help ?

thanks

Hi,

I have used the "StatsSubInfo/Stat_Sub_Info_848MDDvs794NC.mat" as the final subset (excluding site 4 as mentioned in one of the forum threads).

However, to confirm, does the "Dx" variable in the mat file contains the diagnosis (where -1:healthy and 1:MDD)?

Thanks a lot for your continuous help 

严老师好，

    感谢DPABI，让我们能够很方便地进行一系列的脑影像数据的预处理，甚至一些常用的统计分析。

    最近我在分析ROI的功能连接的时候，发现这里无法直接对矩阵进行统计分析，而自己又比较喜欢用matlab，便写了一套代码进行ANCOVA分析，以及将其进行事后检验（bonferroni校正）。

而我也是将结果与DPABI中的图像比较的结果相比对，以确保自己的方法没有问题的。

    而后来我发现了一个问题。就是在使用ANCOVA的时候，其事后检验的t值的计算，可能没有按照协变量的bonferroni t的公式来计算，而是直接根据下图1这个公式来计算的。

    为什么这么说呢，因为我原先使用的是图1这个公式，得到的结果跟DPABI检验ALFF得到的结果一致，我自己也是最近看书的时候才知道在有协变量的时候，应该是要使用图2和图3的公式，会更加精准一些（关于图2里面的分母，根号到底是有没有包含进去，我也还在琢磨，您可以发一下邮箱，我将书籍发送给您）。

各位老师好，

        我想请教几个做ICA之前数据预处理的问题：

       1. 我用DPARSF做预处理，除了slice timing, realign, normalize, smooth四步外，是否要做nuiscance covariates regression? 我查的资料看到有两种说法，一种是无需回归协变量因为ICA能够分离独立信号源无惧协变量影响；另一种说法是推荐在上面四步之外加一个Bias correction，但这个Bias correction是SPM做预处理的步骤，不知在DPARSF里面是否对应nuiscance regression?

Dear DPABI team,

first, I would like to thank you for your work and effort – I enjoy working with DPABI. I hope I didn't miss or overread information in this forum about the questions I'll ask in the following, if so I would like to apologize beforehand.

DPABISurf Installation on Windows

Chao-Gan Yan

1.     Update to latest Win 10 or Upgrade to Win 11.

2.     Enable Virtual Technology in BIOS

2.1.  Restart -> Enter BIOS (during rebooting, hit enter and then F1 or FN+F2)

2.2.  Enable “Intel Virtual Technology”

3.     Install WSL

严老师好，各位老师好，

        我在用DPARSFA对rest-fMRI数据进行预处理后，用DPABI-QC-Generate Group Masks生成mask用于统计，但生成的mask与常见的mask不同，看起来像是经过了旋转之后纳入了部分脑外信息（请参见附上的GroupMask90percent.nii），我检查了每个被试的wAutoMask，仅发现部分被试mask有脑内信息缺失，但都没包含脑外部分（如附图wAutoMask1&2.png），当时的预处理过程见附图Preprocess.png。想请教各位老师为什么生成的GroupMask会出现这种情况？这样的mask应该会影响统计了，请问该如何处理呢？

         多谢各位老师解惑，盼回复！