我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Description

采用我们的母语，能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言，建议所有研究者采用英文发贴，做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想，请在该论坛中采用美丽的中文提问。

DPARSFA数据说明

Submitted by puyunfashi on Fri, 06/10/2022 - 10:20

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

DPARSFA大多数文件夹的组织方式为：工作路径\被试名\数据文件。

FunRaw：该文件夹下包含了所有被试扫描数据的DICOM文件。

FunImg：该文件夹下包含了所有被试的功能像NIFTI格式文件，一般情况下，这些文件由DPARSF中的“dcm2nii”功能自动生成。除非特别声明，以FunImg开头的文件夹下存储的都是NIFTI格式文件。

FunImgA：“A”表示时间层矫正。该文件夹下存储了去除前10个时间点并进行了时间层矫正的数据文件。

FunImgAR：“R”表示头动矫正。该文件夹下存储的是在FunImgA文件中数据的基础上进行了头动矫正后的数据文件。

FunImgARC：“C”表示噪声去除（不包括全局信号回归）。该文件夹下存储的是在FunImgAR文件中数据的基础上进行了噪声去除（不包括全局信号回归）后的数据文件。

FunImgARglobalC：“globalC”表示噪声去除（包括全局信号回归）。该文件夹下存储的是在FunImgAR文件中数据的基础上进行了噪声去除（包括全局信号回归）后的数据文件。

FunImgARCovs：存储了在噪声去除的过程中使用的线性回归模型中包含的协变量。

DPABISurf

Submitted by xujingxian on Wed, 01/31/2024 - 02:46

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

老师您好，我在跑dpabisurf预处理时，通过re-run fmriprep failed subjects重新跑过了，之后应该是从哪一步开始（organize fmriprep?还是segment Subregions?），以及Starting Directory Name应该是从哪个文件夹开始？

进行功能连接统计分析时提示图像左右不等，无法赋值

Submitted by Jenson on Tue, 01/02/2024 - 07:24

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about 进行功能连接统计分析时提示图像左右不等，无法赋值
1 comment
Log in or register to post comments

严老师您好，我在进行功能连接的分析时出现以下问题，数据已进行预处理及Alff，Reho，fAlff，其中在fAlff中有显著差异的脑区我进行了ROIsignal提取，并合并成了一个mask，再此基础之上进行功能连接分析，均能正常运行，但是最后做T检验时出现以下问题，提示左右大小不同，而且我一开始将报错的某个数据删除，之后还是会报错其他的样本数据，最后发现全部报错，请问这就是我数据的问题还是之前的mask的问题？非常感谢！

macOS14 预处理报错

Submitted by Jenson on Sun, 11/26/2023 - 06:39

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

老师您好，我在进行预处理时遇到如下问题：

Generating AutoMasks for sub_001: 0K

Generating AutoMasks finished

Extracting ROI signals...

Reading images from "/Users/jensonyin/Desktop/test/FunImgAR/sub_001/rasub_001_REST_MRI-1_20231008163138_5.nii" etc.

错误使用 Y_ExtractROISignal

File doesn't exist or wrong ROI definition, please check:

/Users/jensonyin/Desktop/test/Masks/WarpedMasks/sub_001_WhiteMask_09_91×109x91.nii.

出错 DPARSFA run（第2762 行）

normalize报错

Submitted by Xuanqi Wang on Mon, 11/13/2023 - 08:05

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about normalize报错
Log in or register to post comments

老师您好，我在reorient时调整了right,up,roll三个参数，接下来的normalize便会报错。但是如果我没有改变这三个参数，normalize便可正常进行，不会报错。请问老师这是什么原因呢？

关于extract roi time courses

Submitted by 许许安若 on Tue, 10/24/2023 - 07:29

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about 关于extract roi time courses
1 comment
Log in or register to post comments

老师您好，我在使用Freesurfer的DesikanKilliary地图集来提取功能连接矩阵，而通过别的一些回答得知我需要的extract roi time courses这个板块，当我把nii文件作为mask输入进去，结果ROI correlation显示110*110的矩阵，实际上这个地图集是113个区域。我想知道有没有什么办法知道是哪三个没有被包括。因为我的研究只需要68个区域。感谢您百忙之中抽空回答我的问题，我将不胜感激！

DPARSFA 运算错误

Submitted by Yunhan He on Sat, 08/12/2023 - 04:17

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about DPARSFA 运算错误
Log in or register to post comments

严老师您好！在运行一批被试的数据时，有一些被试的数据会出现以下问题，但是在其他被试中是可以正常运行的。

预处理报错

Submitted by yuqiang on Tue, 07/11/2023 - 15:47

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about 预处理报错
Log in or register to post comments

GRF校正mask的选择问题

Submitted by tangjinping on Sat, 12/10/2022 - 15:48

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

Read more about GRF校正mask的选择问题
Log in or register to post comments

严老师您好，希望您百忙之中能够解答我的困扰，非常感谢！

请问我GRF校正该选哪个mask？因为我勾选Automask报错，所以结果没有生成groupmask，也没有BrainMask_05_61x73x61.img。只有AllResampled_BrainMask_05_91x109x91.nii。我改怎么选，是空着，还是用AllResampled_BrainMask_05_91x109x91.nii。谢谢您！

关于预处理后图像黑点问题

Submitted by cielo on Mon, 12/05/2022 - 07:04

Forums

我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

用dparsf5.3做的预处理，matlab R2022a，预处理完发现部分被试图像黑点特别多，请老师帮忙解答一下！谢谢！

Subscribe to 我想用中文提问 (I want to post in Chinese)