DPABI/DPABISurf/DPARSF

请问spm的random field theory 和dpabi viewer里的GRF是一样的吗?

Submitted by chunhuichen on

严老师好!

我的数据用spm分析,选FWE校正后没有结果,但是用dpabi 的viwer里的GRF 有一个cluster 是显著的,不知道两种矫正有什么区别?我网上搜了一些东西,说SPM的FWE默认是用的random field theory 矫正的,但是spm只是设置voxel水平的校正后p值,不像dpabi viewer 分别设置voxel 和cluster 水平的p值,因此,不知道SPM 的FWE 是不是确实用的RFT以及他的RFT跟dpabi的GRF有什么区别和联系?

另外,在spm的result结果的右下角有FWHH,我的数据是11.0 11.0 10.5,但是同一个数据用dpabi viewer的GRF估计的平滑度是8.6 8.6 8.2,这是不是说明dpabi 和spm 用了不同的算法,有什么区别呢?

打扰了,多谢指教!

关于预处理参数设置中 Nuisance Regression处理的疑惑!

Submitted by keke on

 为什么在预处理中勾选Nuisance Regression中去除脑白质、脑脊液信号,然后在cluster报告中依然会报告多少体素位于白质中,按理应该cluster都应该位于脑灰质中啊。问题是: Nuisance Regression中的回归脑白质、脑脊液信号意思是不是去除脑白质、脑脊液信号仅留下脑灰质信号?如果不是那确切的理解是什么?感谢老师答复

DPARSF使用相关问题

Submitted by seasonliu on

老师您好,想请教您几个问题。我的需求是:将BOLD数据经过dpabi预处理后,再降采样,然后计算灰质每个体素与其余灰质体素的时间序列相关性。

1. 降采样。

    在预处理中Normalize这一步的时候,是否可以在Voxel Size选项就输入最终目标的体素大小,相当于降采样操作?

    或者预处理后,utilit里“Image Reslicer”是否可以对4D BOLD图像进行降采样?

2. 关于计算灰质每一体素与其余灰质体素的时间相关性。

    如何在标准空间里找到每一个灰质的体素?

    Dpabi是否可以计算每一个灰质体素与其余灰质体素的时间相关性?

附件是我的参数设置以及预处理的图像结果,劳请老师看看我这个结果质量是否可用。

十分感谢。

 

运行PT TFCE程序出错

Submitted by keke on
Warning: Directory already exists. 
> In y_GroupAnalysis_PermutationTest_Image at 43
  In y_TTest2_Image at 81
  In DPABI_STAT_TOOL>ComputeButton_Callback at 521
  In gui_mainfcn at 96
  In DPABI_STAT_TOOL at 42
  In @(hObject,eventdata)DPABI_STAT_TOOL('ComputeButton_Callback',hObject,eventdata,guidata(hObject)) 
Undefined function 'palm' for input arguments of type 'char'.
 
Error in y_GroupAnalysis_PermutationTest_Image (lin

关于Dpabi预处理Reorient和头动的问题

Submitted by ly666 on

各位老师好,

         最近重处理了一些数据遇到了一些问题:

        1、由于重新处理数据,在reorient步骤多少有些差异,似乎这个差异会影响最后的预处理结果?如果用afni的3dwarp,可能不需要手动调节?

       2、不知道头动校正时Dpabi时使用第一个时间点图像还是平均头像做基线检测那6个头动参数的?因为同个数据删除了最后5个时间点发现最大的平动参数比没删之前要大,会是reorient不同影响么?

谢谢老师!

Explanation of Result outputs

Submitted by Vivek Trivedi on

Dear DPABI experts:

I am a bit confused regarding the outputs of the files in the 'Results' folder. There seem to be individual subject image files, m* files and z* files. My questions are: 

1. What do these different files represent?

2. Which files should I use for standardization and statistical analysis?

3. Would it make sense to use an ANOVA test to compare the ReHo results z* files of 3 groups (Control, Early Disease, Advanced Disease)? Will this test be able to show me significant differences in Regional Homogeneity between the 3 groups?