分别用1.5T和3.0T MRI采集的数据,用standardization处理后可以比较么?
请教一下各位老师,DPABI里面提供了一个用于多中心研究的standardization的工具,我有一批分别用1.5T和3.0T MRI采集的数据用该工具处理后,可以进行比较么?
请教一下各位老师,DPABI里面提供了一个用于多中心研究的standardization的工具,我有一批分别用1.5T和3.0T MRI采集的数据用该工具处理后,可以进行比较么?
Dear DPARSFA experts
when running DPARSFA on Linux as well as Mac platform, we faced the following error that is related to the y_spm_orthviews function and it is already described in the forum:
严老师好!
我的数据用spm分析,选FWE校正后没有结果,但是用dpabi 的viwer里的GRF 有一个cluster 是显著的,不知道两种矫正有什么区别?我网上搜了一些东西,说SPM的FWE默认是用的random field theory 矫正的,但是spm只是设置voxel水平的校正后p值,不像dpabi viewer 分别设置voxel 和cluster 水平的p值,因此,不知道SPM 的FWE 是不是确实用的RFT以及他的RFT跟dpabi的GRF有什么区别和联系?
另外,在spm的result结果的右下角有FWHH,我的数据是11.0 11.0 10.5,但是同一个数据用dpabi viewer的GRF估计的平滑度是8.6 8.6 8.2,这是不是说明dpabi 和spm 用了不同的算法,有什么区别呢?
打扰了,多谢指教!
为什么在预处理中勾选Nuisance Regression中去除脑白质、脑脊液信号,然后在cluster报告中依然会报告多少体素位于白质中,按理应该cluster都应该位于脑灰质中啊。问题是: Nuisance Regression中的回归脑白质、脑脊液信号意思是不是去除脑白质、脑脊液信号仅留下脑灰质信号?如果不是那确切的理解是什么?感谢老师答复
老师您好,想请教您几个问题。我的需求是:将BOLD数据经过dpabi预处理后,再降采样,然后计算灰质每个体素与其余灰质体素的时间序列相关性。
1. 降采样。
在预处理中Normalize这一步的时候,是否可以在Voxel Size选项就输入最终目标的体素大小,相当于降采样操作?
或者预处理后,utilit里“Image Reslicer”是否可以对4D BOLD图像进行降采样?
2. 关于计算灰质每一体素与其余灰质体素的时间相关性。
如何在标准空间里找到每一个灰质的体素?
Dpabi是否可以计算每一个灰质体素与其余灰质体素的时间相关性?
附件是我的参数设置以及预处理的图像结果,劳请老师看看我这个结果质量是否可用。
十分感谢。
各位老师好,
最近重处理了一些数据遇到了一些问题:
1、由于重新处理数据,在reorient步骤多少有些差异,似乎这个差异会影响最后的预处理结果?如果用afni的3dwarp,可能不需要手动调节?
2、不知道头动校正时Dpabi时使用第一个时间点图像还是平均头像做基线检测那6个头动参数的?因为同个数据删除了最后5个时间点发现最大的平动参数比没删之前要大,会是reorient不同影响么?
谢谢老师!
Dear DPABI experts:
I am a bit confused regarding the outputs of the files in the 'Results' folder. There seem to be individual subject image files, m* files and z* files. My questions are:
1. What do these different files represent?
2. Which files should I use for standardization and statistical analysis?
3. Would it make sense to use an ANOVA test to compare the ReHo results z* files of 3 groups (Control, Early Disease, Advanced Disease)? Will this test be able to show me significant differences in Regional Homogeneity between the 3 groups?
Hi,
when I'm trying to set the colorbar manually, I get the following error (Matlab2017b):