Dear all, when I was doing analysis of my own data a problem occur after realigned normalized and smoothed when it reached to the regress out nuisance co-variates . the error is : ??? Index exceeds matrix dimensions. Error in ==> DPARSFA_run at 1024

Dear all, I am a beginner of DPARSF. when I was analyzing my data found an error in mapping functional connectivity .Please tell me about the procedure using REST how I can make the Covariate list to regress out nuissance covariates. One more query regarding T1Raw analysis what parameters we have to set for T1 images analysis.

管理员好： 最近看文章很多是用height和extent校正的，也是用一个p值和一个cluster size，问下这个是不是和alphasim差不多或者就是指的alphasim呢？我记得ni上可能02年左右有一篇文章是专门介绍这个校正的原理的，不过具体操作也没有说。 这个校正该如何实现呢？用什么软件呢？或者extent这个cluster应该如何定义比较合理呢？ 谢谢！

老师，你好！ 我现在在学习ALFF，在数据处理过程中遇到了一些问题，希望得到答案。谢谢您答疑解惑。 1. 被试数据扫描时间不同，在一次扫描过程中，有的被试是185volumes，而有的是200volumes。臧老师07年发的Brain Development文章中在遇到此类问题时的处理办法是：将具有200个volumes的被试的最后15个volumes去除，将所有被试的volume数保持相同，都为185volumes，然后进行下一步的分析。我想问的是，不去除这15个volumes可以嘛直接计算每个个体的ALFF map可以嘛？如果必须去除，原因又是什么？

Win XP ,Matlab 7.01 ,SPM5 ,REST 1.6 处理示例数据时出错 Read 3D EPI functional images: "H:\fMRI_tang\REST\ProcessingDemoData\test\FunImgARWS\Sub_001".??? Maximum variable size allowed by the program is exceeded. Error in ==> repmat at 86 B = A(subs{:}); Error in ==> rest_to4d at 63 AllVolume =repmat(AllVolume, [1,1,1, size(ImgFileList,1)]);

求教各位老师，我用REST计算的ROI wise功能连接，结果是一系列的文本文件，请问这些文件怎么使用，怎么看的出两个ROI的相关性？

如果要自动两两计算它们之间的相关系数（做Small World 分析等等时候），处理这些时间序列的程序怎样写呢？ 多谢指教

老师您好： 我现在有一些静息态fMRI数据，但有的图像的TR时间和扫描层数和其他的数据不一样，能否将这些数据一起分析？会出现什么样的结果？

严老师：您好 rest里的功能连接是怎么做的 是用的personal相关吗？

严老师 您好！我选定了19个脑区分别做了病人组和对照组的ROI-WISE的功能连接，得到这19个脑区两两相关的一个19*19的相关系数矩阵，接下来我想做双样本t检验来看哪些脑区的功能连接组间差异显著。rest能做FC的双样本t检验吗？我看到rest的双样本t检验只能选择img格式的文件。 谢谢您的阅读，希望得到您的回复。