ANCOVA Post-hoc分析两组间比较多重比较校正GRF

Submitted by Wayne_ on Fri, 02/05/2021 - 07:23

严老师：

您好！

我用DPABI统计工具箱中的ANCOVA做三组间的方差分析，并选用tukey-Kramer进行post-hoc分析。之后再对两组间的统计结果(比如F_PariwiseDiff_Z_G1vsG2.nii)进行多重比较校正以观察两组间的统计显著区域，在多重比较校正阶段，我对两组间的Z图选用GRF(位于DPABI_VIEW工具中)，但发现无法正确估计FWHMx/y/z以及dLh,这些指标估计出来都是Nan，前面ANCOVA的结果也是利用DPABI计算的。请问老师这样操作是否有问题以及有何建议？

谢谢老师！

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DPABIsurf viewer打开报错

Submitted by KYF on Wed, 02/03/2021 - 04:02

严老师，您好

DPABI viewer打开报错，之前没有问题

rest卸载了，spm8和spm12都试了，dpabisurf重新装了，还是不行

 

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关于smooth的问题

Submitted by spl on Sat, 01/30/2021 - 03:24

各位老师好：

最近在用dparsf进行rs-fMRI的处理，第一次处理时smooth选择了smooth derivatives，但这种情况下获取的平均时间序列是没有进行smooth处理的，所以第二次我在FunImgARCWF的基础上进行smooth处理，但smooth时不知为何会对部分被试进行多次的smooth，获取的有s*，ss*，sss*的数据，请问这是怎么回事呢？我是在Linux服务器上，采用DPARSFA_run函数，对设置好的batch文件进行处理的，请问各位老师，这种情况该怎么处理呢？

 

还有不知为何在服务器上运行速度特别慢，烦请老师看一下，我采用的代码是否有问题呢？
 
mpirun -np 32 matlab -nodisplay -nosplash -logfile 'batch1.log'\ -r "addpath(genpath('/public1/data/DPABI'));DPARSFA_run('/public1/data/fMRI/20210128_power_global_script.mat')"
 
 

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Does FunVolu in the Results of DpabiSurf the same as the Results in DPARSF?

Submitted by YML on Fri, 01/29/2021 - 16:35

Dear Prof Yan,

I am wondering whether the FunVolu in the Results of DpabiSurf the same as the Results in DPARSF? Both of the results are in volume space, right?

Looking forward to your response.

Thank you very much!

Dr Yuan

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DPABI Surf 运行速度慢

Submitted by Doc.he on Wed, 01/27/2021 - 16:28

<p>&nbsp;系统：liunx 18核</p><p>跑一个备试需要24小时，如果添加2个备试运行了4天还停留在Freesurfer哪里，电脑同时卡顿</p>

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2 NEUROSCIENCE / DATA SCIENCE RESEARCH POSITIONS IN LAB AT UNIVERSITY OF LISBON

Submitted by vascosadiogo on Tue, 01/26/2021 - 09:58

2 NEUROSCIENCE / DATA SCIENCE RESEARCH POSITIONS IN LAB AT UNIVERSITY OF LISBON (DPRATALAB.WORDPRESS.COM)&nb

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task fmri preprocess and first level

Submitted by Becky on Wed, 01/20/2021 - 08:41

Hi. Professor Yan

I got two questionas about task fmri data preprocess and first level analysis.

1 There was two kinds of task with four runs for my data. In the preprocessing, should I preprocess the data one run by one run, or one task (two runs) by one task, or four runs together?

2 For the first level analysis, is it necessary to add WM and CSF signal as covariates？ If so,  how do I get WM and CSF signal in the preprocessing?

Look forward to your reply.

Best

Bekcy

 

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数据处理遇到的问题

Submitted by jinpeng on Mon, 01/18/2021 - 07:25

老师您好，我已经run好几个小时了，没有报错，但是并没有新的文件生成，每完成一个预处理过程都要生成新的文件吗？？MATLAB也没有新信息出现，请问是什么原因呢？？

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任务态下做功能连接如何回归掉任务态回归子？

Submitted by doctorsol on Fri, 01/15/2021 - 15:17

1.请教下各位各位老师，做任务态的功能连接前如何回归掉任务态回归子？具体怎么操作呢？

2.是否需要区分block设计和event-related设计？

3.如果希望观察任务本身对功能连接的影响是否还需要回归掉任务态回归子？

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\Results\AnatVolu\文件夹里没有Anat.segment~~.tsv文件。

Submitted by Lee on Fri, 01/15/2021 - 09:48

严老师好，各位老师好。我在使用dpabisurf做预处理的同时，想要使用freesurfer生成的皮层下体积统计数据来进行统计，可是在\Results\AnatVolu\文件夹里并没有Anat.segment~~.tsv文件。请问是因为版本的原因还是我勾选得不对呢？或者说这个文件在其他文件夹里？麻烦各位老师指导一下，谢谢。

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