我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

DPARSF 5.3 预处理回归协变量报错

Submitted by 清茶品也醉 on

严老师   您好!:

               我在用ADNI数据跑预处理流程时,能成功生成T1ImgNewSegment文件,但执行后续步骤就会报错,错误信息如下:

Extracting ROI signals...错误使用 DPARSFA_run (第 2757 行)

找不到尝试执行工作进程的 parfor 循环的源代码(D:\Program\MATLAB2021\toolbox\DPABI_V6.1_220101\DPARSF\DPARSFA_run.m)。

出错 DPARSFA>pushbuttonRun_Callback (第 1854 行)

    [Error, Cfg]=DPARSFA_run(handles.Cfg);

出错 gui_mainfcn (第 95 行)

        feval(varargin{:});

出错 DPARSFA (第 30 行)

关于ANCOVA post-hoc bonferroni的计算结果与方法的探索

Submitted by Oscar on

严老师好,

    感谢DPABI,让我们能够很方便地进行一系列的脑影像数据的预处理,甚至一些常用的统计分析。

    最近我在分析ROI的功能连接的时候,发现这里无法直接对矩阵进行统计分析,而自己又比较喜欢用matlab,便写了一套代码进行ANCOVA分析,以及将其进行事后检验(bonferroni校正)。

而我也是将结果与DPABI中的图像比较的结果相比对,以确保自己的方法没有问题的。

    而后来我发现了一个问题。就是在使用ANCOVA的时候,其事后检验的t值的计算,可能没有按照协变量的bonferroni t的公式来计算,而是直接根据下图1这个公式来计算的。

    为什么这么说呢,因为我原先使用的是图1这个公式,得到的结果跟DPABI检验ALFF得到的结果一致,我自己也是最近看书的时候才知道在有协变量的时候,应该是要使用图2和图3的公式,会更加精准一些(关于图2里面的分母,根号到底是有没有包含进去,我也还在琢磨,您可以发一下邮箱,我将书籍发送给您)。

关于FC和ROIsignals

Submitted by Oscar on

严老师好!

    我在处理fRMI数据的时候,通过ReHo和fALFF计算得到显著的区域,打算将其作为ROI进行功能连接分析。

但我不是很明白functional connectivity和ROI time courses的区别。按照视频中的内容,FC是voxel-wise seed based的相关分析,

而ROI time courses是ROI-wise的功能连接分析,则应该选择ROI time courses才对。但这样说的话,FC又是在什么情况下才使用呢?

 

    另外就是在使用两种方法之后,发现ROI time courses中提取时间序列的数值,就是对应的种子点的均值,这个是可以理解的;而FC得到的

SeedSeries则不是简单的均值(虽然数值上很接近,但确定是不一样的)。关于这个问题,实际上严老师17年就在

http://rfmri.org/content/difference-between-time-series-extracted-functional-connectivity-analysis-and-extract-roi