我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

ADNI数据预处理出现错误

Submitted by Czh on

严老师好:

我对ADNI上下载的原始dicom文件进行预处理,将其转为nii格式后出现两种状态,如下图所示,1:正常的为上方所示,2:异常的如下方所示,各voxel的值过大,造成后续预处理有问题,请问原因是什么?该如何解决?

谢谢老师

DPABISurf Pipeline 报错求助

Submitted by wangmin_CSU on
系统是Windows10 专业版,下载安装好了docker、证书,通过dpabi的utilities检查了数据格式没有错误,试运行能得到gii文件。正式从nii格式文件开始处理时报错。求助严老师,不知道是哪里出了错?具体报错如下:

关于DPARSF计算ROI-wise功能连接问题

Submitted by spl on

老师,您好,我想问一下我在使用DPARSF进行预处理及ALFF,ReHo以及FC等特征提取时是选择在所有特征计算完后进行smooth derivatives,这时候ROI-wise的FC的文件夹是ROIsignals_FunImgARCWF是基于没有进行平滑处理的数据计算的,请问这时候得到的ROI-wise的FC可以直接使用进行下一步分析么?还是说需要在预处理后的数据基础上再进行smooth后再计算ROI-wise的FC呢?

DPASF中cropT1的问题

Submitted by Olivia on

严老师你好,

我手上的T1像是只从dcm转了一步格式的nii文件,没有co和o开头的文件。所以想获得去了脖子co开头的结构像。我用cropT1来获得co和o开头的文件,但最后文件没有任何变化。还提示没有co文件,详见附件。

 

想请教严老师如何用仅转了格式的T1.nii文件来获得去脖子的文件。

谢谢严老师,祝好!

DPABISurf报错(在DPABI5.0/5.1下)

Submitted by wpf1027 on

严老师和各位老师们好!

我在linux下使用DPABISurf会在fmriprep那一步就报错,我跑的是DemoData,系统是Ubuntu1804LTS(运行在虚拟机下),matlab是2014B,docker版本与dpabi版本对应(比如5.1就用5.1的docker,我会把虚拟机还原,不会有其它版本的docker)。

之前用DPABI_V4.3_200401,所有功能一切正常。换成5.0和5.1,matlab都会在启动dpabi的时候出现黄色警告,内容见error1.txt,然后在跑DPABISurf的时候会在fmriprep那一步就报错(Error detected during running fmriprep),内容见error2。