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DPARSF 做到 smooth 的时候报错

Submitted by lynnrain on
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我利用 DPARSF 来预处理我的功能像数据,每个患者有 3 个 session,因此我将 FunRaw 里面设置为 subject001_1、subject001_2、subject001_3...,而T1Raw里面相应的放上 3 个 subject001 的 3D 结构像、然后 subject002...
前面的步骤运行顺利,但是到 smooth 的时候,报了错,并且文件夹中未生成用于检验 normalization 效果的图像文件夹。
系统为win xp,spm8,刚更新了DPARSF 和 REST1.4,报错信息如下:

用DPARSF做slice timing时报错

Submitted by demonpupil on
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严老师,您好:
  我是一名神经病学的博士生,以往搞临床工作对fMRI不熟悉,最近开始准备做磁共振相关的课题。我从美德公司处找来这次在成都讲座发的学习资料,根据里面提供的软件(DPARSF-V1.0, REST2007V1.3, SPM5以及SPM5 Updates)在MATLAB 7.90(R2009b)平台上应用DPARSF对学习资料中的数据进行预处理,但是在进行到slice timing时出现了错误,下面一张图是我用DPARSF进行数据预处理的设置:


在按下Run运行后出现了报错:Removing First 10Time Points:Sub_001 OKRemoving First 10Time Points:Sub_002 OKRemoving First 10Time Points:Sub_003 OK

如何进行临床指标与 ROI 的 ALFF time course 之间的相关性分析?

Submitted by lynnrain on
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通过患者组和正常受试者组的双样本 T 检验,找到了一些患者 ALFF 出现明显异常的区域。现在我想做这个明显异常区域中的 ALFF time course 与临床指标之间的相关性分析,我的做法如下:
  • 利用 add recursively all subfolders 加入了每一名患者的 detrended_filtered 静息态图像
  • 使用 user defined mask file 添加进一个我利用 rest slice viewer 保存的 ROI 图像。
输出的文件是每个被试一个 mat 文件,里面有 200 个 time course 文件(应该是对应的 200 个时间点的图像)。