通过患者组和正常受试者组的双样本 T 检验，找到了一些患者 ALFF 出现明显异常的区域。现在我想做这个明显异常区域中的 ALFF time course 与临床指标之间的相关性分析，我的做法如下：
我的问题：
- 利用 add recursively all subfolders 加入了每一名患者的 detrended_filtered 静息态图像
- 使用 user defined mask file 添加进一个我利用 rest slice viewer 保存的 ROI 图像。
我的问题：
- 我的临床指标是每个患者一个数值，而现在提取的 time course 是每个患者 200 个数值，如何进行相互之间的相关性统计分析？将数值输入 SPSS 似乎是不行的，因为需要一个患者一个临床指标数值，对应一个代表脑区活动性的数值才对啊？
- 对于我的十几个 ROI，能否在 DPARSF 里面一并提取出 ROI 的数值呢？ 由于数据已经经过 DPARSF 的处理，应该如何调整文件夹内容、或者设置 DPARSF 来直接实现批量提取 ROI time courses 的功能呢？
Taxonomy upgrade extras
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问题 2 已经解决，我将 DPARSF 的 time
但是，我注意到提取 time courses 的时候，DPARSF调用的是去除了协变量的图像文件（COV removed），那么是不是这个提取出来的 time courses 主要是用来作功能连接，而非与临床指标的相关性的呢？
问题 1 还请各位多指教。
Re
你不需要提detrend filter里面的文件。
你需要把一组ALFF结果图整理好，放在一个文件夹下，然后用把疾病得分定义为Seed time course的方式来做相关。这样会得到一个相关脑。
当然，你也可以把你感兴趣区ROI里面的所有ALFF值做为一个Course提取出来，用REST->Utilities->Extract ROI Time Couses来提取。然后用SPSS来做更进一步的统计和图表。
seed timecourse 功能在哪里可以找到
我也想做这方面的分析,seed timecourse 是DPARSF还是REST 里能找到？ 希望讲的详细点。谢谢！
ALFF 的结果
还有一个问题,这里说的ALFF的结果是mALFF图还是mALFF-1的图呢
Re
另外，新版的REST在Statistical Analysis里面新增了Correlation Analysis模块，更易用一些，输出带自由度的统计图。
用mALFF图。
选项
我安装了最新的REST，点开statistical Analysis---REST Correlation Analysis,在Add group images 里选中存放mALFF 结果的目录，临床评分的txt文档应选在Add other covariates 里面吗？Mask file选deparsf 里那个brain mask，不知道这样选对不对？我没有提取ROI ,就做全脑相关。
Re
临床评分的txt文档应选在Add Seed Series里面。
如果没有Covariate或者不理解什么是Covariate，右侧两个covariate框不要理它，留空就行。
Mask可以选brain mask。
如何提取ROI
1.“把疾病得分定义为Seed time course的方式来做相关。”这种方式是如何做，可否详细指点一下。
2. “用REST->Utilities->Extract ROI Time Couses来提取。 ”打开REST后还是不知道具体如何做 比如打开Extract ROI Series以后那个Data Directory里面是选什么？ Define ROI点进去以后，再点Add ROI吗？ 然后最简单的是不是就选第一个Spherical ROI? 那个框框里是输入什么呢？Time courses那个框需不需要填呢？
Re: 如何提取ROI
现在在情况下，用另一个模块可能会更清晰一些。
REST->Statiatical Analysis-> Correlation analysis