Why FCmap can't show up after doing all of "functional connectivity" analysis?

Submitted by chlai on
Forums
Dear all:

I did the functional connectivity analysis by REST v1.3 and I found that there were no so called "FCmap" in the results directory and fold. I used SPM statistical T-MAPs derived from GIFT toolbox as ROIs and I also finisehd the DPARSF preprocessing except ReHo, ALFF, etc. Can anybody tell me what's going wrong about this errors?
Thank you.
Dr. Lai 

win7操作系统下,rest不能运行

Submitted by lihong on
Forums

??? Error using ==> cd
Cannot CD to G:temp (Name is nonexistent or not a directory).

Error in ==> tempdir at 31
    curr_dir = cd(tmp_dir);

Error in ==> rest_misc at 119
 dirFCTemp  =dir(fullfile(tempdir, 'fc_*'));

Error in ==> rest>QuitAll at 393
 rest_misc( 'ClearTempFiles');

Error in ==> rest at 34
  QuitAll;
 
输入:rest以后出现这样的情况,请问有解决方案吗?

我的操作系统是win7 32位的,matlab 2009B

[REST_V1.4_100426]Fixed a reading and writing bug of compatibility with SPM8

Submitted by YAN Chao-Gan on
Forums
Dear All!
      REST_V1.4_100420 has been intensely tested in MATLAB7.3 with SPM5. However, there appears a reading and writing bug of compatibility with SPM8.
      Now, this problem has been solved in REST_V1.4_100426.
      Please download the latest release and use it, then this problem will be solved automatically after restarting MATLAB. For an alternative way, you can run rest_Fix_Read_Write_Error.m in REST_V1.4_100426 manually and do not need to restart MATLAB.

DPARSF 做到 smooth 的时候报错

Submitted by lynnrain on
Forums
Taxonomy upgrade extras
我利用 DPARSF 来预处理我的功能像数据,每个患者有 3 个 session,因此我将 FunRaw 里面设置为 subject001_1、subject001_2、subject001_3...,而T1Raw里面相应的放上 3 个 subject001 的 3D 结构像、然后 subject002...
前面的步骤运行顺利,但是到 smooth 的时候,报了错,并且文件夹中未生成用于检验 normalization 效果的图像文件夹。
系统为win xp,spm8,刚更新了DPARSF 和 REST1.4,报错信息如下:

用DPARSF做slice timing时报错

Submitted by demonpupil on
Forums
严老师,您好:
  我是一名神经病学的博士生,以往搞临床工作对fMRI不熟悉,最近开始准备做磁共振相关的课题。我从美德公司处找来这次在成都讲座发的学习资料,根据里面提供的软件(DPARSF-V1.0, REST2007V1.3, SPM5以及SPM5 Updates)在MATLAB 7.90(R2009b)平台上应用DPARSF对学习资料中的数据进行预处理,但是在进行到slice timing时出现了错误,下面一张图是我用DPARSF进行数据预处理的设置:


在按下Run运行后出现了报错:Removing First 10Time Points:Sub_001 OKRemoving First 10Time Points:Sub_002 OKRemoving First 10Time Points:Sub_003 OK

严老师,我是初学者有些问题请教!

Submitted by dragon009 on
Forums
严老师,我是左西年老师介绍后找到这个工具箱的。我第一次使用,有些问题请教。
1.是不是这个工具BOX转换数据的时候很慢?但是我用MRICRON转换起来还是很快的!
2.我在用DPARSF处理的时候,我创建的FunImg不能自动添加被试的数据,所以下面的所有操作都进行不了
3. 是不是添加一下您的第1个视频中讲的“演示视频”有些基础的东西我们这些初学者还是有必要认真学习的!
祝好!

如何进行临床指标与 ROI 的 ALFF time course 之间的相关性分析?

Submitted by lynnrain on
Forums
Taxonomy upgrade extras
通过患者组和正常受试者组的双样本 T 检验,找到了一些患者 ALFF 出现明显异常的区域。现在我想做这个明显异常区域中的 ALFF time course 与临床指标之间的相关性分析,我的做法如下:
  • 利用 add recursively all subfolders 加入了每一名患者的 detrended_filtered 静息态图像
  • 使用 user defined mask file 添加进一个我利用 rest slice viewer 保存的 ROI 图像。
输出的文件是每个被试一个 mat 文件,里面有 200 个 time course 文件(应该是对应的 200 个时间点的图像)。