rest error

Submitted by nazli on
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Dear experts,

I am new in REST  software and i want to apply one sample and two sample t-tests on obtained ALFF maps. 

When I apply t-test from statistical analysis section, Matlab meets error (' rest_Fix_Read_Write_Error'). I applied every instructions that were mentioned in this forum before but it makes no difference.

VBM DPARSF

Submitted by Chen0075 on
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严老师,您好,请问:
在做VBM的modulation时候我们经常这样选择:
单击Modulated normalized选择“affine+non-linear only”。这里的affine+non-linear only是什么意义,是说T1像经过affine和non-linear两次normalization,然后得到一幅MNI的图像?
在DPARSFA的VBM里面是如何选择normalization和modulation过程的。

谢谢!

计算差异的差异

Submitted by chenyuchen1989 on
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老师好:
      我有一个统计的问题。我有两大组,每组内有两组数据,我分别用two sample t-test计算了这两组数据的差异。现在我想计算这两组数据的差异之间的差异,应该用什么方法呢? 还是我一开始统计就应该用其他方法? 请老师指教!谢谢!

请教:如何得到MNI space 中的T1 MRI

Submitted by seuzjj on
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 各位老师,同学好,
请教一下,用DPARSFA处理fMRI时我使用了T1项做coregistration,然后做normalization,但我没找到normalize 到 MNI space之后的T1 MRI. 
是不是说,用做完coregistration 之后的 T1 计算如何normalize fmri 到 MNI space后仅仅把参数用在fMRI上,并没有保存 MNI space中的的T1 ? 有没什么方法可以得到它呢?
另外在PicturesForChkNormalization 中有些subject 有些灰质和颅骨都重合了,如下图横断面,这样的subject是不是就不可以用了?或者是不是哪里的参数设置不合适,如何改进它呢?
非常感谢!

请教一个问题,关于DPARSFA处理后的统计数据的选择。

Submitted by junesums on
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请教各位老师一个问题:
    我用DPARSFA处理数据,选择里面的“Calculate in MNI Space(warp by DARTEL)”处理流程,先跑完ALFF,再做Filter。这样的话最后的统计分析应该是选生成的“Results”文件夹里的数据,还是要选择“FunImgARCWSF”里的数据?
    还有就是,我看了一下数据处理时Matlab里面的代码,Filter时是对FunImgARCWS文件夹里面的数据进行滤波,而不是对Results\ALFF里面的数据进行滤波。这样的话,即是说Results\ALFF里面的数据是没有滤波过的?

附上代码:

报错,头动校正后找不到Masks

Submitted by qqguai on
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老师,您好!

我想算ReHo,但头动校正后程序有如下报错:

 Extracting ROI signals...
  Read 3D EPI functional images: "E:\1 M1 Preparation\Data processing\human data\Reho\FunImgAR\D99".......................................
Error using y_ExtractROISignal (line 188)
Wrong ROI definition, please check: