First, it is hard to understand what "quantization" you used here exactly means.
if you want to extract the mean value of ALFF in a area
put all subject's ALFF map in same directry
then use REST's "extract time series" and define ROIs
the software will deal every subject's ALFF map as a time point, and extract a "time series" from the chosen ROI
老师们，又来烦你们了呵呵，我用REST 做two-Sample T test的时候，把年龄，性别做了协变量回归掉了，那请问我用这个two-Sample T test得出的Peak intensity还是t值吗？还是说我应该在文章里报表格的时候写成F值？
还有，请问我在写文章的Statistical analyses这部分的时候怎么描述呢？我是要写成：ANCOVA analyses was performed on......，with age and gender as covariates of no interest . 还是Voxel-based two-sample t test was performed .....，with age and gender as covariates of no interest .呢，谢谢！呵呵
you can use "extract time series"
if you want to extract the mean value of ALFF in a area
put all subject's ALFF map in same directry
then use REST's "extract time series" and define ROIs
the software will deal every subject's ALFF map as a time point, and extract a "time series" from the chosen ROI
Hi: I think the paper 'The
Hi:
I think the paper 'The oscillating brain: Complex and reliable, zuo et al., Neuroimage, 2010' would be helpful for you.
best wishes!
Binke
谢谢老师们的回复，还有一个问题想问问:
ALFF与体积的相关性
谢谢臧老师及各位老师耐心周全的解答！
我按照建议，使用REST自带工具Extract ROI Signals ，然后把健康被试的mALFFMap放在一个Directory里，Define ROI我放入AAL的PCC即后扣带回这个ROI（通过61*73*61的AAL template，由rest slice viewer 获取），之后点RUN，得到4个文件，里面的xxx_ROISignals.mat或.txt文件里的数值是否就是我所需要的每个被试者mALFF的平均时间序列值？我是否就可以用这些值跟临床量表做相关或做条图之类的？ 如果是的话，有一点让我感到困惑的是，我的这些值怎么这么高啊，都是二点几，三点几这样，有的甚至是四点多，而我看了那篇HBM的AD和ICA比的文章（Spatial Patterns of Intrinsic Brain Activity in Mild Cognitive Impairment and Alzheimer’s Disease: A Resting-State Functional MRI Study），里面也提到用同样的PCC做ROI，里面的值却是一点几的（图见下），同样是用control subjects 我是不是哪部出问题了？
我的control subjects 提取的值如下：
2.5838648363621566e+000
2.8962647136110458e+000
4.4394378696915009e+000
3.7967291713631064e+000
2.8284111466721025e+000
3.0999512211249693e+000
2.7883282064521402e+000
3.5835620495524720e+000
3.2027002821003432e+000
3.2322440617275934e+000
3.5379061659757238e+000
3.8014313504643682e+000
3.1003831886026982e+000
2.8305792604049627e+000
3.2566644649436003e+000
2.4568942371946183e+000
2.6495634952600855e+000
2.9505335614629034e+000
2.2783845375924217e+000
2.6243421396199804e+000
2.6377578817144798e+000
2.9595489641175652e+000
HBM文章里面的截图：
RE
--是的。
你的PCC的ALFF是全脑均值的两倍到三倍多。你用的什么MASK？有可能因为那篇文章限定在灰质MASK。
我的MASK?您是否指的就是我的PCC？我的PCC
我发现似乎我用MALFF做出来的值都是2点几，3点几的，我看了一些文献，他们的值主要是通过条图或者是相关图呈现，有的是0.5-2.5左右，比如臧老师的那篇ADHD里的那幅“标准差图"，,有的是0.5-2.0左右，有的甚至是0.5-0.7的，这是否可能跟ROI包不包括白质有关？（因为白质的MALFF值偏小把均值拉下来了？）,可我做了好几个不同部位的ROI，做出来的值都是偏大的,当然我的几个ROI都是灰质偏多，比如脑内的核团，BA46区，PCC，ACC之类的。但是这个值也太大了点了吧，所以我想问一下一般正常的话MALFF的值的范围应该是多少呢？谢谢！
Re
在那篇HBM文章里面只关心的灰质区域，因此除均值的MASK是限定在灰质上的。
如果采用05 default mask，由于包含了白质和CSF，因此均值要小很多，所以你会看见PCC是两三倍于均值。
多谢严老师指点！原来是这样，谢谢了！
老师们，又来烦你们了呵呵，我用REST
Re
谢谢严老师！呵呵