我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

DPASF中cropT1的问题

Submitted by Olivia on

严老师你好,

我手上的T1像是只从dcm转了一步格式的nii文件,没有co和o开头的文件。所以想获得去了脖子co开头的结构像。我用cropT1来获得co和o开头的文件,但最后文件没有任何变化。还提示没有co文件,详见附件。

 

想请教严老师如何用仅转了格式的T1.nii文件来获得去脖子的文件。

谢谢严老师,祝好!

DPABISurf报错(在DPABI5.0/5.1下)

Submitted by wpf1027 on

严老师和各位老师们好!

我在linux下使用DPABISurf会在fmriprep那一步就报错,我跑的是DemoData,系统是Ubuntu1804LTS(运行在虚拟机下),matlab是2014B,docker版本与dpabi版本对应(比如5.1就用5.1的docker,我会把虚拟机还原,不会有其它版本的docker)。

之前用DPABI_V4.3_200401,所有功能一切正常。换成5.0和5.1,matlab都会在启动dpabi的时候出现黄色警告,内容见error1.txt,然后在跑DPABISurf的时候会在fmriprep那一步就报错(Error detected during running fmriprep),内容见error2。

不同机器采集的数据分析结果出现在脑沟里,如何校正?

Submitted by yunduo on

严老师您好!我用dpabi分析2组静息态数据,2组被试用的机器不同,一组是在高原采集的,一组在平原采集的,用的permutation test/tfce 发现结果差异很大,且结果出现在脑沟里,我重新检查了分析过程(配准都没有问题)重复了2次都是相同的结果,想请教您我需要怎么调整呢?以下为校正后的结果图,期待您的回复,谢谢您!

想请问来自不同机器不同参数的数据的统计方法

Submitted by CRTK on

各位老师好,想请问一下如果想统计不同机器扫描的TR和时间点不同的数据,是不是通过dpabi的standardization模块把所有的数据进行Z-standardization,然后统计的时候在text covariates里面再加一列TR和时间点的数据就可以了。。。谢谢老师们。。。

Dpabi和fmriprep的兼容可能性

Submitted by hp20072929 on
老师您好
 
请问dpabi是否可以兼容fmriprep预处理后的文件 (BIDS 格式)?
 
brain mask; 原始 bold;预处理后的 bold; smooth_AROMAnonaggr_bold.
 
请问预处理后的 bold信号 (preproc_bold.nii)可以直接带入吗?还是需要进一步转换
 
谢谢老师