我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

dparsfa将dicom转nifti的问题

Submitted by cbreal on

        REST版本号V1.8_130615 DPARSFA版本号V2.3_130615 spm版本为spm8 matlab为linux下2010a(我测试的操作系统分别为redhat el5.7和redhat el6.2 测试用户分别为root和普通用户,普通用户有rest和dparsf文件夹下的777权限) 我执行dicom文件转nifti时遇到下面的情况FunRaw转FunImg时,FunImg文件夹会产生,但是nifti格式文件不会产生,程序会一直等待,直到我ctrl+c终止。如果用后面的脚本可以解决这一问题

      这个问题我用fedora 14和opensuse 11.4测试过,同样版本的spm,matlab,REST和DPARSFA是可以转换的。但是我在虚拟机内安装的redhat el5.7就转换失败。请问是什么原因造成的?有没有可能是操作系统的内核问题?

关于使用mask

Submitted by foxet on

我使用fsl里的HarvardOxford-cort-maxprob-thr0-2mm.nii 来获得不同皮层区域的mask。。。

 

我得把模版所在得mni空间转换到我病者的dti空间,但我用非线性转换整个HarvardOxford-cort-maxprob-thr0-2mm.nii 图像后,它里面本来代表不同区域的整数1,2,3,4.。。。,变成了小数。。。。。。。。我想问问怎么办?

文章大修,审稿人关于DPARSF预处理的问题,望请各位同道指教

Submitted by liuchen on

最近自己的一篇文章被PLOS ONE大修,方法学比较简单:一组病人与正常人之间ALFF自发脑活动的比较,数据的处理全部都是使用DPARSF进行的标准处理流程。

但是审稿人提了很多数据处理技术上的问题,鉴于自己的医学背景,望请各位高人指教,谢谢。

第一个问题:Q.2 The investigators excluded data that exceeded a specific motion threshold. However, it would be important to know if there were remaining differences in motion between groups? Was motion used as a covariate in the analyses performed?

在预处理阶段我已经把头动作为变量校正了,还需要在后续的两组比较把头动作为协变量吗?

如果两组头动参数在进行两组比较之后并没有显著性差异,还需要作为协变量吗?

 

关于DPARSF V2.3的degree centrality的统计方法

Submitted by fengyuanc on

严老师:

      您好!近日我使用了DPARSF V2.3进行了degree centrality的数据处理,得到了一批结果,但困扰我的是我应该对哪些数据进行统计学分析。

     如果没错的话,按照之前的经验,好像应该是用“z文件名”的数据进行处理。但是另外一个问题出现了,即不知道加权结果是以什么为加权条件进行计算的,肯请您予以说明!

    感谢您的回复!