AAL模板提取时间序列
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老师你好:
利用DPARSF提取感兴趣区时间序列,采用AAL模板,所选个体为240层,得到矩阵为240*116,AAL模板不是分为90个脑区吗?得到的矩阵不应该是240*90吗?谢谢老师
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老师你好:
利用DPARSF提取感兴趣区时间序列,采用AAL模板,所选个体为240层,得到矩阵为240*116,AAL模板不是分为90个脑区吗?得到的矩阵不应该是240*90吗?谢谢老师
现在标准空间的解剖图都是用t1,
我想问一下,有没有用pd或者t2做标准解剖图的标准空间。(我指直接匹配)
一个是我在wfu_pickatlas的brodomann模版。。一个是HarvardOxford-Cortical的皮层模版,
前者线,后者片状。。。我想问这样用法上有什么差异阿?两者都算是皮层的模版吗?
REST版本号V1.8_130615 DPARSFA版本号V2.3_130615 spm版本为spm8 matlab为linux下2010a(我测试的操作系统分别为redhat el5.7和redhat el6.2 测试用户分别为root和普通用户,普通用户有rest和dparsf文件夹下的777权限) 我执行dicom文件转nifti时遇到下面的情况FunRaw转FunImg时,FunImg文件夹会产生,但是nifti格式文件不会产生,程序会一直等待,直到我ctrl+c终止。如果用后面的脚本可以解决这一问题
这个问题我用fedora 14和opensuse 11.4测试过,同样版本的spm,matlab,REST和DPARSFA是可以转换的。但是我在虚拟机内安装的redhat el5.7就转换失败。请问是什么原因造成的?有没有可能是操作系统的内核问题?
我使用fsl里的HarvardOxford-cort-maxprob-thr0-2mm.nii 来获得不同皮层区域的mask。。。
我得把模版所在得mni空间转换到我病者的dti空间,但我用非线性转换整个HarvardOxford-cort-maxprob-thr0-2mm.nii 图像后,它里面本来代表不同区域的整数1,2,3,4.。。。,变成了小数。。。。。。。。我想问问怎么办?
最近自己的一篇文章被PLOS ONE大修,方法学比较简单:一组病人与正常人之间ALFF自发脑活动的比较,数据的处理全部都是使用DPARSF进行的标准处理流程。
但是审稿人提了很多数据处理技术上的问题,鉴于自己的医学背景,望请各位高人指教,谢谢。
第一个问题:Q.2 The investigators excluded data that exceeded a specific motion threshold. However, it would be important to know if there were remaining differences in motion between groups? Was motion used as a covariate in the analyses performed?
在预处理阶段我已经把头动作为变量校正了,还需要在后续的两组比较把头动作为协变量吗?
如果两组头动参数在进行两组比较之后并没有显著性差异,还需要作为协变量吗?
严老师:
您好!近日我使用了DPARSF V2.3进行了degree centrality的数据处理,得到了一批结果,但困扰我的是我应该对哪些数据进行统计学分析。
如果没错的话,按照之前的经验,好像应该是用“z文件名”的数据进行处理。但是另外一个问题出现了,即不知道加权结果是以什么为加权条件进行计算的,肯请您予以说明!
感谢您的回复!
严老师:您好:在rest论坛里看到:http://restfmri.net/forum/node/53 您提及GroupCorr.m.