dparsfa将dicom转nifti的问题

OldDirTemp=pwd;

cd([ProgramPath,filesep,'dcm2nii']);

if ispc

    if strcmpi(Option,'DefaultINI')

        Option='-b dcm2nii.ini';

    end

    eval(['!dcm2nii.exe ',Option,' -o ',OutputDir,' ',InputFilename]);

elseif ismac

    if strcmpi(Option,'DefaultINI')

        Option='-b ./dcm2nii_linux.ini';

    end

    eval(['!./dcm2nii_mac ',Option,' -o ',OutputDir,' ',InputFilename]);

else

    if strcmpi(Option,'DefaultINI')

        Option='-b ./dcm2nii_linux.ini';

    end

    eval(['!chmod +x dcm2nii_linux']);

    eval(['!./dcm2nii_linux ',Option,' -o ',OutputDir,' ',InputFilename]);

end

cd(OldDirTemp);

#!/bin/bash

rootdir="/home/***/frequency_ybk/analysis";

data_type="FunRaw";

for condition in {"EO","EC"};do

        subname=048

        if [ $data_type = "T1Raw" ];then

          data_type_dst="T1Imgtmp";

        elif [ $data_type = "FunRaw" ];then

          data_type_dst="FunImgtmp";

        elif [ $data_type = "3DT1Raw" ];then

          data_type_dst="3DT1Imgtmp";

        fi

        echo $data_type

        outrootdir="${rootdir}/${condition}/${data_type_dst}";

        mkdir $outrootdir;

        outdir="${outrootdir}/sub${subname}";

        mkdir $outdir

        datadir="${rootdir}/${condition}/${data_type}/sub${subname}";

        cd $datadir;

        fn="${datadir}/*.1"

        cd /***/DPARSF_V2.2_130309/dcm2nii;

        dcm2nii -b dcm2nii.ini -o ${outdir} ${fn};

    done