我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

任务态预处理回归无关信号

Submitted by Lizzie on

Hi,

麻烦问一下任务态的数据是否不能够使用白质、头动信号回归的?我发现回归以后无法用GLM建模,会出现no inmask voxels的报错。不只是DPABI,用CPAC等其它pipeline工具包也会出现这个问题。是否回归去除artefact的方法只适用于rest数据?非常感谢!

种子点之间功能连接

Submitted by Lizzie on

大家好,

麻烦问一下DPARSFA计算种子点之间功能连接是不是就是两个时间序列的相关?如果是的话在DPARSFA中能够计算两个种子点之间的偏相关吗?比如有10个种子点,计算两两相关的时候将其它8个种子点的时间序列作为协变量?

非常感谢!

相同版本DPARSFA处理同一批数据,相同参数但结果不同

Submitted by pingfan2008 on

大家好:我想请教一个问题

我用相同版本的DPARSFA预处理了一批数据(两组人),再用相同参数重复处理后,做双样本T检验比较差异脑区,发现peakMNI  cluster size 和peak intensity 并不相同,例如第一次处理时,insula的peak点在 27  21  -6,cluster size是28,  peak intensity是4.2101。第二次处理时,insula 的peak 点在 +39+9—3,cluster size 是52,peak intensity 是4.6545。大家有没有遇到过类似的问题呢?求解答,谢谢~

关于alphasim等基于cluster level校正的一点思考

Submitted by liufeng on

Dear all,

最近关于cluster level的校正问题讨论的非常热烈,Eklund组的PNAS文章在世界范围内产生了非常大的反响(很多审稿人已经再问这个问题),SPM组和AFNI组也相继发表了回复文章。看完这些文章,我也有一些疑惑,希望严师兄及圈内人士帮我解惑下:

SPM8自带的VBM与VBM8的Estimate&Write有什么区别

Submitted by Fly2themoon on

SPM8自带的VBM,我是按照John Ashburner的VBM Tutorial一步一步实现的。即New Segment->Run DARTEL->Normalize to MNI,

VBM8的Estimate&Write也可以进行VBM分析,得到分割后的图像。

我看文献里说使用VBM处理过后的灰质图像或者白质图像,那这个白质图像是指的SPM8处理后的smwc1*图像,还是没有经过smoothing的mwc1*图像?又或者是VBM8处理过后的m0wrp1图像呢?

结构MRI图像数据处理:有关ROI signal Extractor的问题。

Submitted by Fly2themoon on
我目前做的一个项目是某种大脑疾病的辅助诊断,对象是结构MRI图像。我现在在用DPABI对分割后的灰质图像提取ROI signals值。
我一直没有找到有关ROI signal Extractor的解释。我的理解:比如说我选择了AAL模板(灰质图像大小为121X145X121,体素大小1.5X1.5X1.5;AAL模板为181X217X181,体素大小1X1X1。我先用Image Reslicer把灰质图像变得和模板一样大小。

可否直接使用已经剥离头骨的大脑

Submitted by Lizzie on

Hi,

目前我在分析数据的时候发现dparsfa里面的bet不能修改参数,部分大脑剥离的有点多,因此我自己剥离了一遍。麻烦问一下,我可以一开始在T1Img文件夹内直接存放已经剥好头骨的大脑吗,并在数据分析的时候不再勾选“bet”?会对最后结果产生影响吗?据我所知,好像剥掉头骨的大脑一般是和剥掉头骨的模板配准的,但是鉴于Dparsfa采用的时候SPM(分割以后再配准),所以不太清楚是否会有影响?另外提供剥离头骨的大脑是否会影响New segmentation进而影响配准效果呢?还望释疑问,非常感谢 :)

 

关于DPABI运行

Submitted by echoqiu77 on

严老师好!

我用DPABI4.0 跑数据一夜后出来的这些我有点看不懂啊,请教这是跑完了吗?现在结果里出来的东西比您在视频里讲的要多很多,请问有没有哪里有说明每个文件夹里是什么内容?如果没有跑完我应该从哪里接着跑呢?

不知道怎么把图粘在提问窗口里,只好放在附件里了:分别为做DPABI 的选项;跑出来的结果;Matlab的报错。

万分感谢!