我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

严老师：

          您好！想请问严老师，在用REST软件做统计分析的时候，单样本T检验，zFC文件Base值设成0还是1呢？谢谢您！祝您生活愉快！

严老师：您好。

再冒昧请教：几个关于VBM的问题：

1. DPABI软件中的VBM分析和基于SPM的VBM8分析方法是否一致？
2. DPABI中模板是怎么产生的？是按照Douaud et al. （2007）文章表述的，从两组样本中选取等量的被试产生study-specific模板吗？
3. DPABI的VBM分析是否有应用Jacobian校正？

Douaud, G., Smith, S., Jenkinson, M., Behrens, T.E., Johansen-Berg, H., Vickers, J., James, S., Voets, N., Watkins, K., Matthews, P., James, A., 2007. Anatomically related grey and white matter abnormalities in adolescent-onset schizophrenia. Brain 130, 2375–2386.

先谢谢了。

祝好。

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各位好，北师大贺老师组招收考研调剂，因为是中文版本，故此发在这一版块，欢迎感兴趣的与贺老师联系。

各位老师好！

最近碰到了一个审稿问题如下：

The authors failed to do distortion correction in preprocessing. The inhomogeneous B0 field induced distortion usually happens at prefrontal lobe and cerebellar, where the current study mainly focus on. The absent of distortion correction may undermine the reliability of the results.

我想问下distortion correction应该如何做呢？什么软件可以做？

谢谢

严老师：

         您好！再一次打扰您了，我想请问您下关于附件中错误提示信息，是由于被试头动过大造成的吗？如果这样只能剔除该被试吗？谢谢您！非常期待您的回复，祝您生活愉快！

严老师：您好！我是个新手，想请教您关于如何提取ROI的问题。我想做神经基底节区壳核与全脑的功能连接，壳核的ROI怎么样得到呢？谢谢您，严老师！祝您生活愉快！

严师兄：

好！

读完文章A comprehensive assessment of regional variation in the impact of head micromovements on functional connectomics，受益匪浅。

对于文章中的建议，不太理解。还想进一步请教下。

建议1：• Individual-level correction with the Friston-24 model is recommended. 即：在个体水平建议使用Friston-24 model进行头动参数回归。

严老师：

您好！最近有一篇文章返回来大修，审稿人对于fALFF提出了一个问题，由于自己可能对这个问题理解的不太深入，不知道怎么回答比较好，所以需要您的帮助。

问题如下：

What is the point of band pass filtering to reduce drift and cardiac/respiratory noise AFTER you've calculated fALFF? Shouldn't dealing with drift and physiologic noise be done prior to calculating fALFF?

严老师：

您好！我在做REHO的时候碰到了几个问题，如下：

1、附件里是我做REHO时的相应设置，麻烦您看一下有没有需要改善的地方？

2、我任务态的数据是用spm8处理的，当时的bounding box用的默认的 -78 -112 -50，78 76 85，并在normalize那步下采样成了2*2*2的图像。因为我希望在做校正的时候静息态数据和任务态数据是用的同样的mask，所以我做REHO的时候将dparsfa里默认的bouding box改成了-78 -112 -50,78 76 85，voxel size也改成了2 2 2。由于我是配到T1模板的，所以将所有被试的T1相数据也放进来进行处理，但做完REHO发现，所有静息态的图像都是79*95*68, 2*2*2的，但分割完后的T1相却都是91*109*91, 2*2*2的，不知道这是什么原因？有办法让预处理完生成的T1图像直接就是79*95*68, 2*2*2的吗？

摘要

把科学论文正式发表之前将手稿放到预印本寄存平台上与同行分享，使其得到提早曝光和反馈的做法，已经在物理，天文和数学等领域中被普遍认可。然而，预印本还未被神经科学领域所接受。原因之一可能是缺乏专门服务于神经科学领域的预印本寄存服务。为了解决这个问题，我们启动了一个社区资助项目Preprints of the R－fMRI Network （PRN）。PRN为静息态功能性核磁共振成像（R-fMRI）以及神经科学相关的研究提供免费的手稿提交与寄存服务。PRN会邀请领域内专家作为顾问，同the R－fMRI Network的其他读者一起，对提交的手稿进行同行“评阅”和提供反馈。所有的手稿和对手稿的反馈都会获得一个可供引用的永久链接地址，并可以免费开放获取。PRN的目标是为具有“同行评审”机制的期刊发行体系提供补充平台，使最新的研究发现能在世界范围内快速的流通。我们希望PRN能帮助神经科学领域接受预印本这一模型，为相关研究提速，最终达到能达到增强人类精神健康的目的。