我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

严老师：

         您好！再一次打扰您了，我想请问您下关于附件中错误提示信息，是由于被试头动过大造成的吗？如果这样只能剔除该被试吗？谢谢您！非常期待您的回复，祝您生活愉快！

严老师：您好！我是个新手，想请教您关于如何提取ROI的问题。我想做神经基底节区壳核与全脑的功能连接，壳核的ROI怎么样得到呢？谢谢您，严老师！祝您生活愉快！

严师兄：

好！

读完文章A comprehensive assessment of regional variation in the impact of head micromovements on functional connectomics，受益匪浅。

对于文章中的建议，不太理解。还想进一步请教下。

建议1：• Individual-level correction with the Friston-24 model is recommended. 即：在个体水平建议使用Friston-24 model进行头动参数回归。

严老师：

您好！最近有一篇文章返回来大修，审稿人对于fALFF提出了一个问题，由于自己可能对这个问题理解的不太深入，不知道怎么回答比较好，所以需要您的帮助。

问题如下：

What is the point of band pass filtering to reduce drift and cardiac/respiratory noise AFTER you've calculated fALFF? Shouldn't dealing with drift and physiologic noise be done prior to calculating fALFF?

严老师：

您好！我在做REHO的时候碰到了几个问题，如下：

1、附件里是我做REHO时的相应设置，麻烦您看一下有没有需要改善的地方？

2、我任务态的数据是用spm8处理的，当时的bounding box用的默认的 -78 -112 -50，78 76 85，并在normalize那步下采样成了2*2*2的图像。因为我希望在做校正的时候静息态数据和任务态数据是用的同样的mask，所以我做REHO的时候将dparsfa里默认的bouding box改成了-78 -112 -50,78 76 85，voxel size也改成了2 2 2。由于我是配到T1模板的，所以将所有被试的T1相数据也放进来进行处理，但做完REHO发现，所有静息态的图像都是79*95*68, 2*2*2的，但分割完后的T1相却都是91*109*91, 2*2*2的，不知道这是什么原因？有办法让预处理完生成的T1图像直接就是79*95*68, 2*2*2的吗？

摘要

把科学论文正式发表之前将手稿放到预印本寄存平台上与同行分享，使其得到提早曝光和反馈的做法，已经在物理，天文和数学等领域中被普遍认可。然而，预印本还未被神经科学领域所接受。原因之一可能是缺乏专门服务于神经科学领域的预印本寄存服务。为了解决这个问题，我们启动了一个社区资助项目Preprints of the R－fMRI Network （PRN）。PRN为静息态功能性核磁共振成像（R-fMRI）以及神经科学相关的研究提供免费的手稿提交与寄存服务。PRN会邀请领域内专家作为顾问，同the R－fMRI Network的其他读者一起，对提交的手稿进行同行“评阅”和提供反馈。所有的手稿和对手稿的反馈都会获得一个可供引用的永久链接地址，并可以免费开放获取。PRN的目标是为具有“同行评审”机制的期刊发行体系提供补充平台，使最新的研究发现能在世界范围内快速的流通。我们希望PRN能帮助神经科学领域接受预印本这一模型，为相关研究提速，最终达到能达到增强人类精神健康的目的。

老师们，

圣诞节快乐！

我的一篇文章大修，由于本人水平有限，有个地方理解不了，特此请教：

1.我的静息态数据预处理，完成：时间校正；头动校正；之后回归nuisance covariates (linear trends, Friston 24, and WM & CSF），之后，将Mean FD（Jenkinson）超出mean FD +2SD的被试删除了。----之后再进行后续空间标准，smooth, fALFF等计算;之后将mean fALFF与行为数据进行协相关分析（以每名被试的mean FD(Jenkinson), gender, age为协变量），

请问dparsfa处理流程可以同时计算出reho和alff吗？因为reho是基于未平滑的数据，alff是基于平滑的数据，是否可以鉴别并自动使用相应平滑和未平滑的数据计算alff和reho。还是说必须算两次，alff算一次，reho算一次，由人为手动设置。

附件是dparsfa计算reho和alff的流程图

谢谢

老师好，我在跑静息态的预处理的时候总是报错了，我是自己定义的ROI坐标提取时间序列，错误信息如下：

严老师：

您好！我做了三组数据N、L、R，用dpabi中的statitical analysis做Two-sample T-test后，生成的L_R的T2.nii在viewer中可以打开，但N_L和N_R的T2.nii在viewer中却打不开，报错信息如下，急等指教，谢谢!

Reading images from "C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_002.nii" etc.

 Image Files in Group 1:
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_002.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_003.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_004.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFM