我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

Permutation Analysis-分析VBM产生出的灰质体积时出错了

Submitted by Freshman2013 on
老师们:好。
 
冒昧打扰。VBM产生的灰质体积,两组A组与B组,在使用dpabi最新版本跑A组与B组的双样本T检验时,再进行 Permutation Analysis出错了,貌似提示是模板出错,但我尝试选用了和跑出AB两组voxel size一致的全脑mask  或 灰质mask 作为mask时,都出错了。

Realign parameters如何使用?

Submitted by Lizzie on

Hi,

麻烦问一下SPM里Realign生成的6列头动参数分别是什么呀?3个transtion和3个rotation吗?单位是什么呀,我看着都很小,都是0点几,但是用dparsfa预处理完生成的头动参数里面有很多都是大于2mm的,麻烦问一下这个是怎么计算出来的呀?最后就是FD,有没有什么公式的?非常感谢~~

with or without global covariates

Submitted by butterch on

大家好!

 我用DPABI分析一批静息态数据,在“Nuisance Covariates Regression”那一步勾选了“Both with & without ” global covariates,最后只生成一种结果。之前有人提问过这个问题,严老师在回答时列出了一系列应该生成的文件夹,我跟那个提问者的问题一样,缺少其中的几个文件夹,详见图。其中“FunImgARglobalCovs”文件夹是空的。

我想请问的是,出现这种情况的原因是什么呢?我最后是不是只得到without global covariates的结果呢?

另:我使用的电脑是win10系统,SPM8,DPARSF 4.1 Advanced Edition.

谢谢,祝大家工作顺利~

 

有关DPABI中smooth的一些问题

Submitted by butterch on
     大家好,
   
      第一次使用DPABI,在使用过程中有一些疑惑,烦请各位老师解惑:
    
      1.视频中讲计算degree centrality的时候,不能使用smooth后的数据,那么在计算完DC后需要平滑吗?我都试了下,发现两次的结果相差较大。(备注:我使用的是第三处的smooth,见下文)
    
     2. 我先用smooth后的数据计算了ALFF和fALFF;跑完之后,用未经过smooth的数据计算ReHo和FC,然后选择了‘smooth derivatives’。我现在的疑问是,选择这个选项后会不会把我之前算好的ALFF和fALFF重新平滑了?我发现results文件中ALFF和fALFF文件夹日期有改动。
    

任务态预处理回归无关信号

Submitted by Lizzie on

Hi,

麻烦问一下任务态的数据是否不能够使用白质、头动信号回归的?我发现回归以后无法用GLM建模,会出现no inmask voxels的报错。不只是DPABI,用CPAC等其它pipeline工具包也会出现这个问题。是否回归去除artefact的方法只适用于rest数据?非常感谢!

种子点之间功能连接

Submitted by Lizzie on

大家好,

麻烦问一下DPARSFA计算种子点之间功能连接是不是就是两个时间序列的相关?如果是的话在DPARSFA中能够计算两个种子点之间的偏相关吗?比如有10个种子点,计算两两相关的时候将其它8个种子点的时间序列作为协变量?

非常感谢!

相同版本DPARSFA处理同一批数据,相同参数但结果不同

Submitted by pingfan2008 on

大家好:我想请教一个问题

我用相同版本的DPARSFA预处理了一批数据(两组人),再用相同参数重复处理后,做双样本T检验比较差异脑区,发现peakMNI  cluster size 和peak intensity 并不相同,例如第一次处理时,insula的peak点在 27  21  -6,cluster size是28,  peak intensity是4.2101。第二次处理时,insula 的peak 点在 +39+9—3,cluster size 是52,peak intensity 是4.6545。大家有没有遇到过类似的问题呢?求解答,谢谢~