我想用中文提问 (I want to post in Chinese)

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采用我们的母语,能够进行迅捷有效的沟通。但是鉴于英文是科技通用语言,建议所有研究者采用英文发贴,做为训练自己英语的良机。如果你实在觉得英文无法表达你的思想,请在该论坛中采用美丽的中文提问。

严教授,您好:我想咨询dpabisurf的一个问题,谢谢

Submitted by mshua001 on

严教授,您好:我想咨询dpabisurf的一个问题,谢谢

您在视频中说皮层重建这一步可以在linux中做,我有的freesurfer跑的皮层重建,能不能把结果整合到dpabi中用呢?如果能怎么操作呢,谢谢您

用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错(2)

Submitted by April on

尊敬的严教授:

        您好!因为之前的帖子没法把图片贴到正文,所以我又开了个窗口,望理解。之前的帖子链接是:http://rfmri.org/content/%E7%94%A8dpabi%E5%A4%84%E7%90%86%E8%A2%AB%E8%AF%95%E7%81%B0%E8%B4%A8%E6%97%B6%EF%BC%8C%E8%BF%9B%E8%A1%8C%E5%88%B0roi-signal%E5%87%BA%E7%8E%B0%E4%BA%86%E6%8A%A5%E9%94%99

        您说是并行工具箱的问题,我重新下载了matlab又试了试。我做了两种尝试,但是都没有成功。老师,接下来咋办啊?

严老师,您好,dpabisurf的时候报错,不能跑,谢谢您

Submitted by mshua001 on
Conversion required 0.177000 seconds. 
Converting T1 Images:Sub_001 OK
Starting parallel pool (parpool) using the 'local' profile ...
connected to 6 workers.
Removing First 10 Time Points: Sub_001 OK
 
Converting DPARSFA to BIDS structure...
Parallel pool using the 'local' profile is shutting down.
Preprocessing with fmriprep, this process is very time consuming, please be patient...
bids-validator@1.4.0
 
1: [WARN] The recommended file /README is missing.

请教关于DPABISurf的一些问题

Submitted by 于雪雪 on
尊敬的老师们,您好!
        我想问下我已经在freesurfer中处理了皮质重建,可以用这个在freesurfer中处理了的数据在dpabisurfer进行后续数据处理吗?还有我想问下dpabisurf中的mask中的SurfLH,SurfRH、Volume是不是一般选默认的模板,可以为空吗?若为空的话,会有什么后果吗?期待老师的回复,万分感谢!
 
 
 
 
 

图像处理中的困惑

Submitted by dany on

老师们好,我在处理一批图像,但是这些图像采集的不太好,主要是结构像、功能像图像信号不均匀,额叶整体信号很低,甚至肉眼难以分辨灰白质(听说当时MR机器出了点问题)。静息态图像配准标准化效果不好,但是做VBM分析分割、标准化的图像看起来还不错。另外部分图像相位编码方向可能是左右。

用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错

Submitted by April on

尊敬的严老师:

         您好!我在用dpabi处理被试灰质时,进行到roi signal出现了报错,我尝试了好多操作也问了周围的同学,但是还是不行,麻烦老师帮忙看看我的设置是不是出现了问题,谢谢老师啦!

相关的设置信息和报错信息如图片所示,其中在sphere中坐标设置是选取了之前操作中跑出来的cluster中peak的坐标值(就是选的数值比较大的坐标值)

非常感谢老师在百忙之中的解答。

 

祝好!

志霞

设置信息如下: