各位老师们好!
最近处理的一批数据,其中有些被试是头部上下颠倒的,于是用fsl翻转过来并在fslview里看着正常后,后用DEPARSFA处理。结果是,那些头部曾经颠倒了的被试result都为空,而其他没有颠倒的被试都挺正常的,看PicturesForChkNormalization也是那些颠倒的被试normalize没配齐。
我的处理步骤是,slice timing, realign, coregister, Newsegment+DARTEL, Nuisance covaraite regression (poly trend 1, Fiston 24, Global signal, WM signal, CSF signal), Warp Masks into individual space, ALFF/ReHo等,normalize, smooth。 本来想贴图上来的,可能是网速慢贴不上,只好这么简单描述了。
然后我就逐个文件去检查,发现到FunImgARCF看着都正常,头部颠倒的和没有颠倒的被试都差不多,T1ImgNewSegment 灰白质分割也是正常的,但Masks 和Results里都是空的。
所以我怀疑是从Warp Masks into individual space这一步就出错了,但是我能做的也只是勾选它而已啊,我该怎么办呢?如果说可能是原始文件转得不对,但是我在fslview里看着已经转过来了啊。
另,检查到FunImgARC的时候发现,做完Nuisance covariate regerssion 之后的图像很乱看着像加了白噪音啊,是本来就该这样还是我勾选的协变量太多了?
多谢!
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Re: mask出错了,能怎么改正么
最后一个问题请参考http://www.restfmri.net/forum/FAQ #4.