严博您好,我和同学在用REST1.8数据处理,在去除协变量这一阶段时,遇到了以下问题;
1、视频上说在regress out covariates 那个界面的上面那个大框里面导入被试者的所有子文件夹,这个所有子文件夹指哪些文件夹?是在算出ALFF之后,含有新生成的img和hdr的那个文件夹吗?因为视频上这一步的操作是接在ALFF之后的,如果不是,那正确的那些子文件夹是哪些?
2、然后,视频中提到在下方那个含有省略号的按键上出现了一个TXT文件,叫做covlist.txt,然后下面又补充说明,必须要以Covaribal_txt:为第一行,下面依次是三行代码,我们的问题是是不是要在目标文件夹里面新建一个叫covlist.txt的文件,然后里面输入视频上出现的Covaribal_txt:X;\process\sub003.。。?这一步操作到底是什么意义?如果不是,该怎么办?
3、接下来,视频上面提到了四个协变量,第一个头动参数,rp_name.txt,和下面三个脑脊液、脑白质参数等等,然后又说要把这四个参数结合到一个TXT文件中,接着出现四行代码,视频说可以用matlaB执行合并四个参数的工作。我们的问题是:用matlab如何将这4组参数结合起来?是在matlab界面里面输入这四行代码吗?我们尝试了一下,第一行命令回车后提示错误,找不到rp_name.TXT,这个文件应该是进行头动校正后生成的吧?我们在那一步操作后的文件中找到了一个以RP_打头的TXT文件,里面有几列代码,之后我们将所有的4组代码黏贴到一个TXT文件,结果错误,后面的操作也无法进行。
以上是我们运行去除协变量时遇到的问题,视频上说的太简单了,希望严博能进一步详细讲解一下,也许是我们初涉脑功能处理,很多都是自己摸索的。谢谢严博!
1、视频上说在regress out covariates 那个界面的上面那个大框里面导入被试者的所有子文件夹,这个所有子文件夹指哪些文件夹?是在算出ALFF之后,含有新生成的img和hdr的那个文件夹吗?因为视频上这一步的操作是接在ALFF之后的,如果不是,那正确的那些子文件夹是哪些?
2、然后,视频中提到在下方那个含有省略号的按键上出现了一个TXT文件,叫做covlist.txt,然后下面又补充说明,必须要以Covaribal_txt:为第一行,下面依次是三行代码,我们的问题是是不是要在目标文件夹里面新建一个叫covlist.txt的文件,然后里面输入视频上出现的Covaribal_txt:X;\process\sub003.。。?这一步操作到底是什么意义?如果不是,该怎么办?
3、接下来,视频上面提到了四个协变量,第一个头动参数,rp_name.txt,和下面三个脑脊液、脑白质参数等等,然后又说要把这四个参数结合到一个TXT文件中,接着出现四行代码,视频说可以用matlaB执行合并四个参数的工作。我们的问题是:用matlab如何将这4组参数结合起来?是在matlab界面里面输入这四行代码吗?我们尝试了一下,第一行命令回车后提示错误,找不到rp_name.TXT,这个文件应该是进行头动校正后生成的吧?我们在那一步操作后的文件中找到了一个以RP_打头的TXT文件,里面有几列代码,之后我们将所有的4组代码黏贴到一个TXT文件,结果错误,后面的操作也无法进行。
以上是我们运行去除协变量时遇到的问题,视频上说的太简单了,希望严博能进一步详细讲解一下,也许是我们初涉脑功能处理,很多都是自己摸索的。谢谢严博!
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Re: 严博您好,想请教一个关于去除协变量的问题
这些代码和操作都整合进DPARSF流水线了。你可以采用pipeline来更方便地处理,或者研究一下那里的代码,如果对如何实现的细节有兴趣的话。