Dear Doctor YAN:
No matter I used VBM and DARTEL processing 3D-T1 images, I found that after the two-sample t-test, the voxels is larger than the brain module in SPM or REST, just like the picture below. I displayed the images before I preocessed them and set the Gaussian FWHM 8 mm. I do not know why.
Hi,
Hi,
Seems you applied a mask when performing two-sample t-test on gray matter files (swc1*)? How did you generate that mask -- which seems a little bigger?
Best,
Chao-Gan
结构态的mask
严老师：
我在用这两种方法时都没有使用mask，因为有论坛说无论VBM还是DARTEL，做出来的voxel是1.5x1.5x1.5mm，而spm或者rest slice viewer的大脑模板好像是1x1x1mm，是否我需要先把two-sample t test做出来的图先reslice为1x1x1mm，再使用spm或者rest默认的mask，还是先在two-sample t test中使用mask，再reslice？我可能有些概念表述的不是很清楚，不知道您是否能理解？
你好！
你好！
如果没有加mask，脑外只要有值，就会进入统计（spm也会自动生成这样的mask)，所以看起来图会比脑更大。
你可以施加一个mask，如果你的mask (1x1x1)与数据(1.5x1.5x1.5)不一致，你可以先将mask reslice到同你数据一样的精度（REST->Utilities->Reslice)。你在统计中，应用这个重采样之后的mask就可以了。
祝一切顺利！
超赣
默认的模板是否可以用
谢谢严老师之前的耐心解答，我今天用rest想做ANVOA，用的是rest的61x73x61这个模板，结果显示如图，想知道why
默认的模板是否可以用
谢谢严老师之前的耐心解答，我今天用rest想做ANVOA，用的是rest的61x73x61这个做mask，结果显示如图，想知道why
你好！
你好！
请先把这个mask reslice到同你数据一样的精度（REST->Utilities->Reslice) 。他们具有同样的voxel size和dimension才可以使用。具体步骤参加rfmri.org/Course第二个部分。
祝顺利！
超赣