Submitted by haohaoxuexi on Fri, 11/23/2012 - 06:56 老师, 你好!我做完了 ALFF 与MMSE 的连接,发现了比如有PCC与MMSE成正相关,此时如何能找到个人的PCC的ALFF 的那个值呢。因为我看别人都会再做个线形图,横坐标是MMSE,那纵坐标的,即每个人的,怎么找呢? 谢谢! 学 Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 你好,我简单说一下我是如何实现这个的,仅供参考: 1. 将显著性相关的脑区(如你的pcc)保存为mask。这个可以用rest_sliceviewer的save cluster实现。 2. 提取mask内的平均ALFF值,这一步我是用代码实现的。 [data,v,h]=rest_readfile('*.img'); %读入一个被试的ALFF map data=reshape(data, [61*73*61,1]); %61,73,61是矩阵的维数 mask=rest_readfile(‘*.img’); % 读入你的mask mask=reshape(mask,[61*73*61,1]); tmp=data(logical(mask),:); %提取mask内每个体素的ALFF值 s=size(tmp); tmp=sum(tmp’); tmp=tmp/s; %mask内平均的ALFF值 3. 将每个被试的平均的ALFF值和对应的MMSE值放到excel表中,使用相应的功能作图(这一步多种软件可以实现,excel我想应该是比较简单的吧)。 祝好 Log in or register to post comments Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 如果对编程不熟,第二步也可以通过REST-Utilities->Extract ROI signals实现。 Log in or register to post comments Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 请问一下是提取被试fisherZ变换后的图中的ROI?还是变换前的图呢? Log in or register to post comments Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 ALFF不做Fisher Z变换。 你是用什么文件做的统计,这里就基于这些文件提取。 Log in or register to post comments Forums Discuss Log in or register to post comments
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 你好,我简单说一下我是如何实现这个的,仅供参考: 1. 将显著性相关的脑区(如你的pcc)保存为mask。这个可以用rest_sliceviewer的save cluster实现。 2. 提取mask内的平均ALFF值,这一步我是用代码实现的。 [data,v,h]=rest_readfile('*.img'); %读入一个被试的ALFF map data=reshape(data, [61*73*61,1]); %61,73,61是矩阵的维数 mask=rest_readfile(‘*.img’); % 读入你的mask mask=reshape(mask,[61*73*61,1]); tmp=data(logical(mask),:); %提取mask内每个体素的ALFF值 s=size(tmp); tmp=sum(tmp’); tmp=tmp/s; %mask内平均的ALFF值 3. 将每个被试的平均的ALFF值和对应的MMSE值放到excel表中,使用相应的功能作图(这一步多种软件可以实现,excel我想应该是比较简单的吧)。 祝好 Log in or register to post comments
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 如果对编程不熟,第二步也可以通过REST-Utilities->Extract ROI signals实现。 Log in or register to post comments
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 请问一下是提取被试fisherZ变换后的图中的ROI?还是变换前的图呢? Log in or register to post comments
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。 ALFF不做Fisher Z变换。 你是用什么文件做的统计,这里就基于这些文件提取。 Log in or register to post comments
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。
1. 将显著性相关的脑区(如你的pcc)保存为mask。这个可以用rest_sliceviewer的save cluster实现。
2. 提取mask内的平均ALFF值,这一步我是用代码实现的。
[data,v,h]=rest_readfile('*.img'); %读入一个被试的ALFF map
data=reshape(data, [61*73*61,1]); %61,73,61是矩阵的维数
mask=rest_readfile(‘*.img’); % 读入你的mask
mask=reshape(mask,[61*73*61,1]);
tmp=data(logical(mask),:); %提取mask内每个体素的ALFF值
s=size(tmp);
tmp=sum(tmp’);
tmp=tmp/s; %mask内平均的ALFF值
3. 将每个被试的平均的ALFF值和对应的MMSE值放到excel表中,使用相应的功能作图(这一步多种软件可以实现,excel我想应该是比较简单的吧)。
祝好
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。
如果对编程不熟,第二步也可以通过REST-Utilities->Extract ROI signals实现。
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。
请问一下是提取被试fisherZ变换后的图中的ROI?还是变换前的图呢?
Re: 如何找个人的ALFF的活动强度值,或是功能连接强度的值。
你是用什么文件做的统计,这里就基于这些文件提取。