如何提取图像中体素的ReHo ALFF

Submitted by lwz110911 on
 大家好：
                                     
   例如这幅图，我想把体素的坐标、体素值（ReHo，ALFF）给提取出来。最重要的是在rest中clusters report提供的报告中不是也列出了一部分体素么，我最关心的是如何把上面的体素给找到。可是我的老师给我提出了一种方法，就是代价比较大（把整个图片的体素值都提取出来，还要进行坐标上的转换）我感觉比较繁琐。请问有没有好的方法、建议。
                            谢谢大家了

YAN Chao-Gan

Wed, 11/07/2012 - 17:04

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你好！

没有太理解你的问题。你是要知道每个体素的坐标值以及体素值（如ReHo值）吗？如果是提取这样的海量信息的话，你老师的建议（把整个图片的体素值都提取出来，还要进行坐标上的转换）应该是最好的方法了。

Cluster report 本身会报告peak点的坐标。

如果非需要整个cluster的所有坐标（也会有非常多值），可以写一点程序实现。不知道你对写程序掌握多少，基本思路如下：
1. Save cluster
2. 找出所有为1的体素的voxel index I J K
3. Head.mat * [I J K 1]可以得到MNI坐标值
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