有关阈值的选择

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老师：
      您好！
      由于我要选择我做的单样本t检验的结果做mask，在进行t检验时，请教阈值如何选择？在spm中有FWE、FDR（xjview中有这个选项）中涉及阈值的选择，我需要严格一些的结果，改如何选择呢，另外cluster的选择有没有一定的规定，一般选择多少？
      另外，用spm和rest做出的结果有些出入，我怎么选择呢？
      由于一些参数选择的不同，得到的结果有些不同，不同的结果会使最后做组间差异的结果也会不一样，这一点比较困扰我，再次请教老师您，麻烦了！

阈值的选择，只要超过要求的最低标准，如何选择是有一定任意性的。如果选择单样本t检验的结果做为mask，目的是为了进行两组之间的比较，不同的标准或参数，两组间比较的结果，的确会受影响，这个问题无法避免，我认为只要在文章中讲清楚就可以了。
"用spm和rest做出的结果有些出入"，请把问题描述得再具体些。

      感谢臧老师的解答！
      关于“用spm和rest做出的结果有些出入”，是这样的：用spm做出结果在xjview里report时有三个簇，但是到了rest里就是两个簇了，还有以前做处理数据的时候有时候也会碰到这样的问题，有时候结果一样的时候，可能调的参数（比如cluster）不一样，如果参数调一样了，结果会有些不一样。
     另外，在用spm时在做”result“里FWE里限定了阈值0.001，在xjview里还能在FDR里矫正吗，可以重复选择吗。可能这几个选择阈值的意义我还有些不明白，再次麻烦老师的解答，谢谢！

ZangYF

Mon, 08/13/2012 - 02:54

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用SPM和xjview结果不同，有可能是因为内在的参数选择不同。这个问题，我不专业。
对于同一个结果，肯定不能重复进行多重比较校正。比如，不能先用A方法对某个t图进行多重比较校正，之后，再用B方法在前面的基础进行校正。

YAN Chao-Gan

Wed, 08/15/2012 - 18:03

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 需要注意一下，采用xjview查看结果，P值默认采用的是单侧检验，而REST采用的是双侧检验。同样设定0.05, REST的T阈值要比xjview严格一些。

另外，团块的连接定义准则有可能会不一样，xjview使用SPM的边连接准则，而REST slice viewer的准则是可以通过rmm值来进行调节的。
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