严老师 您好!:
我是一名初学者,目前正在学习应用dpabi对静息态数据进行处理,想请教一些有关normalize 的问题。
在控制面板中我发现normalize的默认参数为[3 3 3],通过检查我自己的.dcom数据发现原始数据是[2 2 2.3]。想请问一下1)在处理这批数据时我需要将默认参数修改为「2 2 2」吗?2)如果我需要修改,那前面的bounding box 需要修改吗?3)我其实自己尝试了将参数修改,但在最后进行统计分析的时候如果需选择61*73*46的模版统计时会报错,但如果选用自制90%的mask就不会报错,想问一下我应用生成的90%的mask有没有问题,为什么在「3 3 3」的时候61*73*46 模版可以进行统计,而「2 2 2」时不行?
非常感谢!
1. 3 3 3或2 2 2都可以。
1. 3 3 3或2 2 2都可以。
2. bounding box不需要修改
3. 61*73*61是3 3 3的模板,不是2 2 2的
感谢严老师!还有几个问题想请教老师
好的!真的非常感谢严老师回答我的问题。
为了更好地理解数据处理的流程,我尝试使用分步的方式进行数据处理(应用dpabi软件,按照不同的预处理步骤分别计算ALFF、Reho、vmhc、FC。
我的处理步骤如下:首先计算ALFF和fALFF值,因为是多层扫描所以保持slice timing 这一步骤的默认值,使其自己读取扫描信息。然后进行realign、normalize、smooth等预处理步骤,然后计算ALFF以及fALff值。得到result文件中的z.ALFF文件。(问题1.分步计算的zALFF文件是不是相当于一起计算的resultsS里的szALFF?)
然后再计算reho值时应用生成的FunImgARCW文件先进行fiter,得到FunImgARCWF再进行reho计算
FC应用FunImgARCWSF文件,通过定义ROI计算
最后再应用FunImgARCWSF文件没有勾选VMHC选项之前的smooth,结果生成FunImgARCWSFsym文件并用其计算VMHC
再统计计算时,我遇到了新的问题。我选取得normalize的参数是【2 2 2】,在对alff、reho、fc进行统计计算时mask选的都是91*109*91结算过程顺利,但在VMHC统计时选择91*109*91会报错显示:
Array dimensions must match for binary array op.