各位大大,请教关于在Rest的工具里做Alphasim 矫正:
步骤:点开REST AlphaSim, 先点Estimate进行平滑核大小的估计,即:在Input Statistical Map选择我之前进行t检验的结果;在input Mask File 选择REST自带的全脑mask;最后一个FWHM of Statisticl Map留空(如附件1),这样估计出来的平滑核大小是15.94;然后在 REST AlphaSim这个主页面的Mask也选择REST自带的全脑mask,P取0.01其他保持默认值(如附件2),最后跑出来的文件提示需要417个体素矫正之后p才小于0.05 .
两个疑问:1. 这样在基于全脑mask 做Alphasim 矫正的结果不是应该和Rest Viewer里提供的表的结果差不多吗?
2.当其他所有 选项不变的情况 ,我发现P Threshold里 选的P值约大,需要的体素个数反而更多是为什么?如我前面的那个例子:当p取0.005时,最后跑出来的文件提示只需要274个体素矫正之后p就小于0.05了;而当p取0.001时,最后跑出来的文件提示只需要110个体素矫正之后p就小于0.05了。
请教一下,我是哪里没选对还是我的理解有误??
非常感谢!
Attachment | Size |
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Estimate 的选择 | 6.1 KB |
REST AlphaSim主界面的选择 | 9.12 KB |
Forums
谢谢高磊在QQ里答复我,问题的第2点我已经明白。
谢谢高磊在QQ里答复我,问题的第2点我已经明白。
但关于问题1 我想追问:
我用DPABI做预处理时选的平滑核是6mm,可是在我用这个 REST AlphaSim来估计平滑核时,故出来的是接近16mm的水平,这直接导致最后即使p取0.001, 也需要100多个体素才能达到检验标准。
我想请教一下,为什么这个估计和我们实际选择的值有那么大的差距? AlphaSim一定要按照这个步骤来进行矫正吗?因为我感觉这个标准出来,在全脑voxel水平来比较常见衡量脑功能的指标(ALFF ,REHO,功能连接)都没有有任何结果啊!
大脑本身具有平滑性,ReHo本身也是一种平滑
大脑本身具有平滑性,ReHo本身也是一种平滑。所以预处理的平滑,不等于图像的实际平滑程度。后者要更大。
您的问题1我也不懂,能不能解释一下?另外评估FWHM的时候
您的问题1我也不懂,能不能解释一下?另外评估FWHM的时候,不同的MASK为什么结果不同?不是应该参照原始的统计图么?