如何从spm统计图筛选信息做报告

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老师请问您个问题,如何从volume图找出有意义的坐标做报告,这张图太诡异了,NaN有意义吗,如果报告激活区,那些是有用的点,谢谢

YAN Chao-Gan

Wed, 09/07/2011 - 20:54

Nan表示团块水平不显著?我平常用AlphaSim多一些。你通常需要报告团块峰值点的值和坐标。 Part 2 of Course介绍了比较多这方面的内容,请参考。http://www.restfmri.net/forum/Course

chenlele

Thu, 09/08/2011 - 01:06

In reply to by YAN Chao-Gan

谢谢老师,我后来用了同样的数据和参数在spm8里做,results用spm5(因为spm8没有FDR校正)结果显示了之前NaN的那一列值现在全部有数值值显示了,请问我的这种做法可行吗? 另外还想请教老师两个问题,来个文献的一句话:“We sought to control for effects from mis-registrations first by using FA = 0.15 as lower threshold to avoid voxels in primarily CSF or grey matter regions and second by using only voxels that all subjects had in common” 这里的first步骤是不是直接在spm里做Specify 2nd-level时直接作为 Threshold masking的Absolute threshold 的参数填进去就好呢?不同人的说话不太一样我都搞晕了。 然后second步骤是不是可以在IMCalc做个mask,然后作为Specify 2nd-level的explicit mask的参数文件图像呢? 可是我把所有被试的fa图照相乘后(expression: i1.*i2.*i3.*i4.*i5.*···.*i20),之后我就display这个mask,结果是图像大部分都是黑色的,只要一小簇有点白,所以现在都不知道怎么处理

ZHANG_RESTadmin

Sat, 09/10/2011 - 04:26

我看了你的r.jpg的图,图下面的字显示你在数据处理时设置的似乎有问题。 1. 平滑是用的FWHM怎么是 0 0 0? 正常情况下这个数应该大于voxel size 2. resel怎么数目非常非常大?而且resel的大小怎么只有0. 正常情况下这个数应该小于voxel number 我想这是你得出NaN(非数)的原因。 请检查数据处理过程。

我采取了同样的参数设置后,在spm8里面计算出来的结果显示这一行有值了这里不好贴图,这里的帖子有图,http://52brain.com/read-htm-tid-14263-fpage-1-page-1.html 因为是DTI数据,本来voxel大小为1.8*1.8*3,normalize时是writting options的voxel size 设置为2*2*2,所以平滑时的FWHM设置为4,就不知为什么不是显示4了

这个图里显示的结果和数字应该是正确的。 这就解释了你为什么之前那张图里显示NAN,因为你那张图里显示的数字是错的。 这种情况下,应相信spm8的结果。 同时,你要想想之前的时候为什么或者自己怎么把参数设错了。
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