相关系数的算法

Submitted by pkuwcb on
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rest算出来的相关系数,数学算法是什么,没有找到软件算法的相关文章。 例如,用functional connectivity,算ROI wise,两个ROI之间有个相关系数。 或者算voxel wise时,全脑每个voxel和特定ROI之间的相关系数。 应该不是线性相关,我将time course 用SPSS或者excel算出来的相关系数,和rest的不一样。 是不是考虑了频率成分?

AAL time courses没有变量名,即90个脑区的名称

Submitted by Fmri-networks on
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问题1: DPARSF's standard processing steps: 12. Extract AAL or ROI time courses for further analysis (optional). 对一些数据提取时间序列后,得到的90个时间序列的变量名为AAL??TC如下 AAL62TC: [125x1 double] 尽管可以做初步的功能网络分析,但是不利于后面结合脑神经精神文献和数据进行生物学意义上的讨论。 因此能不能在软件中给出一个AAL??TC与具体的脑区名称相对应的表格。 问题2: 能不能在DPARSF中设计提取所有体素voxels的时间系列?(同时体素的大小可以自定义,以便根据实际的计算能力来决定voxel的数目。) 十分感谢严博!

关于alphasim校正的问题

Submitted by liufeng on
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我想问的问题是我用alphasim校正,用了三组。首先p=0.005算出cluster size是406,用p=0.001算出cluster size是183,用p=0.01算出cluster是624;我选的cluster size都是第一个alpha小于0.05所对应的size。那么他们的结果都是产生了一个p=0.05的校正吧?如果是,我分别用三组校正去看我的spmt0001.img,校正后的结果不一样。 p=0.001cluster size183这一组最强,校正后没有任何结果,p=0.01cluster624这一组校正最弱,出来很多结果。我想问一下如果都是模拟的p=0.05,那么出来的结果为什么不一样呢。 期待您的回复!

Rest 2 sample T test error

Submitted by yhcha@mednet.u… on
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Hi everyone, With great help from this forum, I was able to get the first level analsysis done through DPARSF. I am trying to do a two sample T test with 5 patients and 5 controls. I add an age text file as the covariate. I get this error message below. Thanks for your help in getting past this hurdle. Yoon-Hee

One Sample T Test

Submitted by Rita on
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Does it make any sense to do this on sm-1_ReHo data for a group of subjects? OR does ReHo only make sense in a comparison (i.e. paired t test or two way test) to some other baseline/condition? When I tried to make a oneway test it basically gave me a whole brain activation.

how to explain the "search volume" in spm?

Submitted by xuercan on
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最近,被review问及了一个问题,如下: It was unclear to me the nature of the correction cited for the correlation of CESD(抑郁量表) with ICA signal. Was this voxelwise or clusterwise? What was the search volume? 关于第二问我很费解,What was the search volume. 这个要我回答什么呢? 关于search volume,见附件。如何正确的回答他这个问题,search volume 的官方解释到底是什么,我查了很久,没找到书面的解释。请高人多多指点。

detrend

Submitted by sunshine on
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各位老师: 我在做静息态分析的时候有一步不是很清楚原理,请问去线性漂移“detrend”这一步的目的是 什么?为什么要做这一步?