请教臧老师和严老师关于模板的问题

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 想请教两位老师,我的有的文献上在灰质模板上展现VBM的结果很好看,也想做出这样的图片(第一张图),但是用DARTEL最后生成的第6个灰质平均模板(第二张图)发现这个模板比平时rest里和xjview里的模板(第三张图)要扁一些,尤其是在冠状位上,请问怎么才能得到第一张图那种灰质模板呢?

 第一张图是得到的,我不太清楚。
第二图的冠状位看起来,的确比第三图扁一些。首先要确定是否在同一个坐标。如果是的话,第二个图是你自己的数据得到的平均灰质图像?如果是,可能需要仔细检查一下空间配准是否存在问题。

YAN Chao-Gan

Fri, 04/19/2013 - 17:21

Hi,

Template_6.nii is not in MNI space but in the DARTEL template space. You need to apply the matrix in Template_6_2mni.mat to make it in MNI space. 

T_MNI_Affine=load('Template_6_2mni.mat');
[Data Head]=rest_ReadNiftiImage('Template_6.nii');
Head.mat =
T_MNI_Affine.mni.affine;
rest_Write4DNIfTI(Data,Head,'Template_6_MNI.nii');

Best,

Chao-Gan

 谢谢严老师赐教,请问这一串命令是实现把DARTEL空间的模板转换到MNI空间吗?不好意思,还得请教您一下怎么用啊,我直接复制粘贴到matlab里运行会报错,应该是DPARSFA下的一个脚本吧?请严老师再详细指导一下好吗?祝一切顺利!

 严老师你好,我在T1ImgNewSegment的第一个被试文件下下执行了这些命令,但是执行到最后一行时出现了如下错误,求指导!谢谢! 

??? Error using ==> rest_Fix_Read_Write_Error at 64
Meet error while fixing read write error. Please restart MATLAB, and run "rest_Fix_Read_Write_Error" before starting anything.
 
Error in ==> rest_WriteNiftiImage at 92
   rest_Fix_Read_Write_Error; %YAN Chao-Gan, 100426.
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