an error occured when using dparsfa

Submitted by lucy on Tue, 07/10/2018 - 13:00

hello!

professor Yan, when i processed my data with dparsfa based on matlab2013a, spm12, an error always occured.

but i 'm sure that i had used same parameters processed data successfully once a time

just with smooth value change from 4mm to 6mm

here are the infor that shoewed in matlab :

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DICOM数据转化

Submitted by AlRay on Sun, 07/08/2018 - 01:56

严老师好：

我拿到的DICOM数据是每一个slice（比如有35个）上每一个TP（比如有240个）一个DICOM文件，一共8400个DICOM文件。老师展示的DeMo数据中的FunRaw中，是一个TP一个文件（共240个文件），请问应该如何将前面的8400个文件转化为后面的240个文件呢？

谢谢

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Rest-AlphaSim

Submitted by cuihuifang on Wed, 07/04/2018 - 10:39
尊敬的老师：
      您好！我是一名研究生，在The R-fMRI Network网站上看到您关于AlphaSim校正的教学视频，有几个问题想向您请教。

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使用dpabi view进行surface view with BrainNet viewer时错误

Submitted by keke on Tue, 07/03/2018 - 15:00

按教程我在overlay中添加Yeo2011_17Networks_MNI152_FreeSurferConformed1mm_LiberalMask.nii.gz以及在Load colorbar from MAT中载入Yeo2011_7Networks_Colormap_ForDPABI等文件后，点击surface view with BrainNet viewer按钮，matlab运行框显示错误,我看不到我的图像结果（说明：已事先安装好brainnet viewer):

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关于用统计分析模块添加协变量的疑问

Submitted by keke on Mon, 07/02/2018 - 12:05

尊敬的严博士，我在用统计模块进行两个独立样本T检验时，在添加患者组和对照组后，还添加了Mean FD，性别，年龄，教育年限等协变量，但是我发现在点Run之后，并没有运行协变量，得到结果和我没有添加协变量时是一样的，我怀疑是我编辑的协变量文件不正确。例如我建立一个记事本文件（OCD.txt）,假如我有13个被试，我就编辑成13行，4列；每一行从左到右以此是：性别，年龄，教育年限，Mean FD；打开后内容如下：

1 24 16 0.061
1 55 12 0.089
1 18 09 0.107
0 44 15 0.057
0 36 09 0.093
1 38 16 0.109
0 33 11 0.116
0 23 16 0.062
0 29 12 0.054
1 17 11 0.117
1 49 09 0.104
0 27 15 0.127
1 35 12 0.048
（想让老师们帮我看一下，我这个编辑的方式是不是有问题？感谢老师，我爱你们）

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关于用统计分析模块分析VMHC结果的疑问

Submitted by keke on Sun, 07/01/2018 - 05:29

结果如下：DLH 0.091699 voxels^-3 before correcting for temporal DOF

 

FWHMx = 3.744741 voxels

FWHMy = 3.687451 voxels

FWHMz = 3.645997 voxels

FWHMx = 11.234224 mm

FWHMy = 11.062353 mm

FWHMz = 10.937990 mm

DLH = 0.092841

VOLUME = 174972

RESELS = 50.345928

尊敬的严博士，关于这些结果我不是很明白，我想了解一下上面这些结果分别表示什么意思？感谢亲爱的严博士

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为什么我的mask图像是方形，完全不是头颅的形状

Submitted by keke on Sun, 07/01/2018 - 03:20
为什么我的面具图像是方形，完全不是头颅的形状
我检查过，在我进行质量控制模块时，我的T1Img，FunImg，以及标准化后图像都是正常的，但是我的面具文件里的图像都特别奇怪，完全不是形似头颅，而是方块形的的，求老师们给我一些建议，可能是哪里出问题了，还有就是我不知道这个论坛，怎么发图片信息？

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Error using GCA in RESTplus

Submitted by lcacciam on Wed, 06/27/2018 - 18:18

Hello! I am attempting to use RESTplus V1.2 for a granger causality analysis on fMRI data, but I keep getting the following error:

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How to add covariates in Mixed Effect Analysis?

Submitted by megan on Tue, 06/26/2018 - 10:01

Dear Dr. Yan,

I encountered a problem while doing Mixed Effect Analysis. I wanted to add covariates (age, gender and handness). But the problem is that the covariates are the same for both condition 1 and condition 2.

I added as

group1_cov.txt

group1_cov.txt

group2_cov.txt

group2_cov.txt

Then Dpabi ran for hours and gave weired results. I also tried to name the covariates differently but it didn't work either. I wonder what is the proper way to add covariates in Mixed Effect Analysis. 

Thank you!

Best Regards,

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DPARSF error using copyfile

Submitted by spl on Tue, 06/26/2018 - 08:11
严博士，您好：
                   不好意思打扰您，我是来自郑州大学的一名研究生，最近在学习DPARSF对fMRI数据进行预处理时遇到问题，在查找资料无果后，故此写这封求助信向您求助，望您在百忙之中能够抽空帮忙解答疑问。具体问题如下：

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