dpabi-Standardization module

Submitted by xiamo on Tue, 10/01/2019 - 00:43

尊敬的DPABI社区，

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任务态预处理

Submitted by Becky on Fri, 09/27/2019 - 02:15

各位老师好，请问用DPARSF预处理任务态fmri数据时，如下图设置是对的吗？

所有数据放在一起预处理时总是会报错，所以我是每个被试单独进行预处理，这会与所有被试一起预处理时有差别吗？

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纹状体种子区分割问题

Submitted by YinLu on Fri, 09/27/2019 - 02:12

老师您好：

        很抱歉打扰您了，我在使用fsl的组件first进行分割纹状体种子区时遇到了一个问题，我是想把壳核（Putmen）进一步分割为背后部（dorsoposterior part），腹后部（ventroposterior part），背前部（dorsoanterior part），腹前部（ventroanterior part）共4个分区。文献给出的方法是根据y=0，z=0轴作为边界分割，我想请教一下您怎么用first分割，官网里面没有具体的描述，谢谢老师！

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DPABI预处理报错

Submitted by lyx on Fri, 09/27/2019 - 01:49

严老师您好，我在用dpabi处理猴子数据时总是在T1像分割时报错，如下图所示。请问是什么原因？感谢老师答疑解惑!

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dpbaisurfer问题

Submitted by shenlan on Wed, 09/25/2019 - 15:33

继续请教严老师，第二次彻底格式化重新安装win10 专业版管理员身份运行matlab，按照install指引安装了docker，复制了许可证，中间matlab没有报错信息。随后再次重启matlab，运行dpabisurfer后仍然报错。还请各位严老师及其他各位老师帮忙分析原因，谢谢！

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儿童静息态功能连接

Submitted by Rookie on Wed, 09/25/2019 - 03:55

严超赣老师：

       您好！我在学习处理一批儿童的静息态数据，遇到了一些问题，而且身边的师兄师姐也没有处理这个数据的经验，因此只能来请教一下您，希望您能不吝赐教。

       静息态功能连接对头动很敏感，但是儿童（本实验中为9~10岁）生性好动，即使是静息状态下扫出的数据头动也都普遍较大。如若使用目前推荐的FD>0.2的标准进行scrubbing，有80%的volume都被会被去除。本想着可能儿童的标准会更松一点，去查看相关的文献，结果发现做儿童静息态功能连接的文章不太多，偶尔的几篇也没有很详细的控制头动的问题。请问，对于儿童这种本身头动普遍较大的群体，做静息态功能连接应如何控制头动？控制到什么程度？您的文章“A comprehensive assessment of regional variation in the impact of head micromovements on functional connectomics”指出，Friston-24 approach能有效控制正连接和负连接，此处我是不是也能就只进行Friston-24回归，不用scrubbing？

      谢谢！

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Two open positions at Dr. Diana Prata's lab @ Lisbon

Submitted by vascosadiogo on Tue, 09/24/2019 - 15:59

http://www.eracareers.pt/opportunities/index.aspx?task=global&jobId=117352 Coordination of statistical analysis of retrospective neuroimaging and clinical data, using artificial intelligence (machine learning) for the development and validation of neuroimaging biomarkers (diagnostic models)  of neurodegenerative illnesses, with high potential of clinical applicability; coordination with scientific and medical teams to set up clinical trials (Beta-user experience for the clinical setting validation of the above developed biomarkers).

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Automask图像异常

Submitted by Zeqiang Linli on Tue, 09/24/2019 - 02:45

您好，老师！

我在预处理时点了Automask这个选项，但是生成的mask是一些不规则的多边形，后面在生成group mask时也是如此。

我想问这样会不会影响到后面预处理的准确性？

这样的group mask应该不适合在统计比较中使用吧？那么我可以用一个先验的brain mask作为统计比较的mask吗？

期待您的回复！祝您万事胜意！

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dpabi预处理过程中遇到的错误

Submitted by SHUANG HONG TANG on Tue, 09/24/2019 - 02:38
严老师您好，我在使用dpabi预处理数据的时候出现以下错误，我使用的是macos系统，多次实验都出现同样的问题，百思不得其解，所以来请教老师的高见。
 
祝好！
 
 
 
Reorienting T1 Image Interactively for Sub_001: OK
Reorienting Functional Images Interactively for Sub_001: 
 
Reorienting Functional Images Interactively for Sub_001: OK
Warning: Directory already exists. 
> In DPARSFA_run (line 1208)
  In DPARSFA>pushbuttonRun_Callback (line 1795)

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