blogs

  • 大家好，请帮忙分析这篇文章的数据是怎么处理的

    Submitted by nutrition-li on
    Forums
    Discuss2
    最近在看一篇文章，有些数据分析方面的问题搞不清楚，如果有人处理过类似的数据，请不吝赐教。谢谢！
    MR Image Acquisition
    Images were acquired with a multislice, singleshot EPI sequence to achieve whole brain coverage: 40 axial slices, TR=5 seconds, TE =35 illiseconds,
    3.5-mm slice thickness, in-plane resolution 1.8 mm by 1.8 mm at the Magnetic Resonance Imaging Facility, Salford Royal NHS Foundation Trust, Salford. A SENSE 8-channel head coil was used for radio frequency transmission and reception.

  • 今天碰到的几个问题

    Submitted by marvelancet on
    Forums
    Discuss
    Taxonomy upgrade extras
    discussion
    近期碰到几个问题
    拿出来大家看看：

    做统计分析结果呈现的时候，因为是手动配准，用的AFNI tlrc坐标，最终结果在各种工具中呈现结果不同：
    rest slice viewer效果最好，与模板匹配




    同样的结果放到MRIcroN就不匹配（我用的模板和mask是同源的）
    可能是MNI坐标与tlrc坐标不同的关系





    在spm里面也一样 不匹配：

  • dparsf潜在的bug?

    Submitted by marvelancet on
    Forums
    Discuss
    Taxonomy upgrade extras
    help
    DPARSF
    亲爱滴们：

    今天碰到这样一个问题，焦头烂额：
    由于这批数据需要手动配准，所以我的处理流程如下：
    1. 用dparsf批处理至realign。
    2.用spm做coregister.
    3.用AFNI转换格式后做Normalize
    4.转换个格式后，将得到的EPI相文件放入FunImgNormalized文件夹。
    然后启动dparsf，
    先跳过Smooth做的ReHo，很顺利，detrend, filter, reho...没有任何问题。
    然后继续用dparsf做alff以及falff，操作过程如下：
        -matlab下输入dparsf
        -依次去掉smooth前所有的勾
        -选择工作目录
       - 输入时间点190
       - 选择自定义模板 

  • help 2: dparsf

    Submitted by marvelancet on
    Forums
    Discuss
    Taxonomy upgrade extras
    DPARSF
    hi,

    the previous error i brought up was fixed by adding the line
        "rest_Fix_Read_Write_Error"
    before initializing dparsf.

    however, the time between pressing the bottom "run" and actual data precessing is much longer  in the linux environment than windows (just now i experienced a 15 min lag).
    so is the time for data precessing.
    what might the problem be? how can i fix it?
    i'm currently using double systems on my laptop, which are windows XP and linux fedora ver 12.

  • help: dparsf error

    Submitted by marvelancet on
    Forums
    Discuss
    Linux, fedora 12
    Matlab 2010a
    Dparsf lastest ver.
    spm8
    error:

    ??? Error using ==> DPARSF('editSliceOrder_Callback',gcbo,[],guidata(gcbo))
    Error: This statement is incomplete.

    Error in ==> DPARSF>editSliceOrder_Callback at 369
        handles.Cfg.SliceTiming.SliceOrder =eval(['[',SliceOrder,']']);

    Error in ==> gui_mainfcn at 96
            feval(varargin{:});

    Error in ==> DPARSF at 39

  • 左右脑位置

    Submitted by sunshine on
    Forums
    Discuss
    各位老师：
          现在我有一个关于左右脑的问题想向各位老师请教一下。附件中是一个mask，我把它命名为cacudate(L),因为用mricro打开叠加在CH2模板上显示的是左侧。想请问老师这个mask是不是就是对应在核磁机上打开看到的左侧，是真实人脑的右侧呢？
          非常感谢！

  • 请教：REST DICOM sorter报错

    Submitted by huchongyu1983 on
    Forums
    Discuss

    dicom文件穿不上来，提示
     Only files with the following extensions are allowed: jpg jpeg gif png txt doc xls pdf ppt pps odt ods odp img hdr nifti nii.
    我把dicom的文件重命名，后面加了后缀.jpg传上来，能帮我看看吗？
    还有一个问题请教，关于slice view能不能也像xjview的volume一样，出一个表格，然后点表格内的坐标，图像的十字架就可以自动定位到坐标所在的位置？