我目前做的一个项目是某种大脑疾病的辅助诊断,对象是结构MRI图像。我现在在用DPABI对分割后的灰质图像提取ROI signals值。
我一直没有找到有关ROI signal Extractor的解释。我的理解:比如说我选择了AAL模板(灰质图像大小为121X145X121,体素大小1.5X1.5X1.5;AAL模板为181X217X181,体素大小1X1X1。我先用Image Reslicer把灰质图像变得和模板一样大小。不知道这一步对不对?) ,最后得到的116个脑区的值(数值范围都是0~1)是否是每个脑区的像素值的叠加?还是说这116个值有别的含义呢?
要先Reslice。 是灰质图像在某AAL脑区内的均值。
要先Reslice。
是灰质图像在某AAL脑区内的均值。
嗯嗯。谢谢严老师。那我的理解就是
嗯嗯。谢谢严老师。那我的理解就是:因为这个灰质图像是modulation之后的,所以说,得到的AAL模板下的每个被试的116个脑区的均值可以表示灰质的volume信息?而没有经过modulation的灰质图像得到的就是density信息?同理,我也可以得到AAL模板下白质的这些信息?
You are right.
You are right.
Thank you for your reply, I
Thank you for your reply, I really appreciate that .
Now , I wanna ask another question?
How do we get the values of every 116 regions of the GM volume map, is this related to the DPABI algorithm ?
I just wanna know the meaning behind these 0~1 values .
Thank again for your reply.
Good Luck
If you want to get the mean
If you want to get the mean value for each of the 116 regions, just use the ROI Signals Extractor.
Thank you for your reply.
Thank you for your reply.
Maybe I didn't express clearly.
now i know the 116 values (between 0~1) from ROI Signals Extractor shows the mean value of each 116 regions. but if i don't know how to explain the meaning of the size of number . just like 0.3 means smaller GM volume? or 0.5 means a little bigger GM volume?
Thanke you again.
关于DPABI的一点建议
严老师,您好。
首先,非常感谢您们团队的辛勤努力,dpabi帮助了我很多。
我觉得,是否可以在每个模块里加一个help按钮呢?这样的话,方便大家了解该功能的作用。您比如说,这个Utilities里的ROI Signals Extractor功能,进入它的界面后,可以加一个help按钮,help里可以先介绍下这个ROI Signals Extractor的大概功能,然后介绍该界面一些按钮输入的一些参数等。
这是我的一点建议。谢谢。
We are setting up a wiki
We are setting up a wiki (http://wiki.rfmri.org).
Please contribute your knowledge to the wiki (every member of rfmri.org can edit).
yeah, i'd like to help but
yeah, i'd like to help but now i'm a newbi.haaaa
and this is a former questions, maybe i don't express clearly...
now i know the 116 values (between 0~1) from ROI Signals Extractor shows the mean value of each 116 regions. but if i don't know how to explain the meaning of the size of number . just like 0.3 means smaller GM volume? or 0.5 means a little bigger GM volume?
and the most important question: why these values could show GM volume ? is this related to the VBM ?
For interpretation, you have
For interpretation, you have to read more literature (e.g., on VBM).
Okay, That's a good answer,
Okay, That's a good answer, thank you .
有关116个数值的疑问
严老师,
您好,
最近我的课题出了点问题,我在排查错误,最后觉得可能是提取到的数据的问题。
是这样的:我的Matlab程序的输入数据,基于的就是提取出的这116个数值。您说这116个数值是AAL模板下灰质在每个脑区的平均值。平均值是说:我把这个脑区里每个体素的值(灰度值)都加起来,然后求平均?另外,还想请教下,我是否可以得到每个脑区的值的总和,如何得到呢?
最后一个问题:还想跟您确认下,对于灰质图像,modulation之前的灰质图像代表了density信息,所以此时用AAL模板得到的就是116个脑区的density信息;同理,modulation之后的灰质图像,我提取的116个数值是volume信息?
严老师,
严老师,
您好,
最近我的课题出了点问题,我在排查错误,最后觉得可能是提取到的数据的问题。
是这样的:我的Matlab程序的输入数据,基于的就是提取出的这116个数值。您说这116个数值是AAL模板下灰质在每个脑区的平均值。平均值是说:我把这个脑区里每个体素的值(灰度值)都加起来,然后求平均?另外,还想请教下,我是否可以得到每个脑区的值的总和,如何得到呢?我想,应该是有相关函数的,不过我没有找到。
所以,很想请教下严老师和大家以上几个问题。
研究函数,把mean改为sum
研究函数,把mean改为sum