结构MRI图像数据处理:有关ROI signal Extractor的问题。

Submitted by Fly2themoon on
我目前做的一个项目是某种大脑疾病的辅助诊断,对象是结构MRI图像。我现在在用DPABI对分割后的灰质图像提取ROI signals值。
我一直没有找到有关ROI signal Extractor的解释。我的理解:比如说我选择了AAL模板(灰质图像大小为121X145X121,体素大小1.5X1.5X1.5;AAL模板为181X217X181,体素大小1X1X1。我先用Image Reslicer把灰质图像变得和模板一样大小。不知道这一步对不对?),最后得到的116个脑区的值(数值范围都是0~1)是否是每个脑区的像素值的叠加?还是说这116个值有别的含义呢?

嗯嗯。谢谢严老师。那我的理解就是:因为这个灰质图像是modulation之后的,所以说,得到的AAL模板下的每个被试的116个脑区的均值可以表示灰质的volume信息?而没有经过modulation的灰质图像得到的就是density信息?同理,我也可以得到AAL模板下白质的这些信息?

Thank you for your reply, I really appreciate that  .

Now , I wanna ask another question?

How do we get the values of every 116 regions of the GM volume map, is this related to the DPABI algorithm ?

I just wanna know the meaning behind these 0~1 values .

Thank again for your reply. 

Good Luck

Thank you for your reply.

Maybe I didn't express clearly.

now i know the 116 values (between 0~1) from ROI Signals Extractor shows the mean value of each 116 regions. but if i don't know how to  explain the meaning of the size of number . just like 0.3 means smaller GM volume? or 0.5 means   a little bigger GM volume?

Thanke you again.

严老师,您好。

首先,非常感谢您们团队的辛勤努力,dpabi帮助了我很多。

我觉得,是否可以在每个模块里加一个help按钮呢?这样的话,方便大家了解该功能的作用。您比如说,这个Utilities里的ROI Signals Extractor功能,进入它的界面后,可以加一个help按钮,help里可以先介绍下这个ROI Signals Extractor的大概功能,然后介绍该界面一些按钮输入的一些参数等。

这是我的一点建议。谢谢。

yeah, i'd like to help but now i'm a newbi.haaaa

and this is a former questions, maybe i don't express clearly...

now i know the 116 values (between 0~1) from ROI Signals Extractor shows the mean value of each 116 regions. but if i don't know how to  explain the meaning of the size of number . just like 0.3 means smaller GM volume? or 0.5 means   a little bigger GM volume?

and the most important question: why these values could show GM volume ? is this related to the VBM ? 

严老师,

您好,

最近我的课题出了点问题,我在排查错误,最后觉得可能是提取到的数据的问题。

是这样的:我的Matlab程序的输入数据,基于的就是提取出的这116个数值。您说这116个数值是AAL模板下灰质在每个脑区的平均值。平均值是说:我把这个脑区里每个体素的值(灰度值)都加起来,然后求平均?另外,还想请教下,我是否可以得到每个脑区的值的总和,如何得到呢?

最后一个问题:还想跟您确认下,对于灰质图像,modulation之前的灰质图像代表了density信息,所以此时用AAL模板得到的就是116个脑区的density信息;同理,modulation之后的灰质图像,我提取的116个数值是volume信息?

Fly2themoon

Sat, 11/05/2016 - 03:03

严老师,

您好,

最近我的课题出了点问题,我在排查错误,最后觉得可能是提取到的数据的问题。

是这样的:我的Matlab程序的输入数据,基于的就是提取出的这116个数值。您说这116个数值是AAL模板下灰质在每个脑区的平均值。平均值是说:我把这个脑区里每个体素的值(灰度值)都加起来,然后求平均?另外,还想请教下,我是否可以得到每个脑区的值的总和,如何得到呢?我想,应该是有相关函数的,不过我没有找到。

所以,很想请教下严老师和大家以上几个问题。