老师您好，感谢您与您的团队为fMRI分析做出的贡献。作为fMRI与DPABI的完全初学者，我在分析过程中遇到一些问题冒昧向您提问。以下是我们数据的参数与遇到的问题
1.数据形式
我们的扫描对象是大鼠全脑，每个样本各得到一个功能像的dcm与结构像的dcm文件
功能像参数（Fun）：
echo time: 18ms
repetition time: 15000ms
repetitions: 300
scan time: 7m30s
slices: 43
slice thickness: 0.8mm
image size: 75x50mm
field of view: 30x20mm
结构像参数（T1）：
echo time: 33ms
repetition time: 4003.557ms
repetitions: 1
scan time: 4m16s227ms
slices: 50
slice thickness: 0.5mm
image size: 256x256mm
field of view: 35x35mm
版本：DPARSF 5.3
2.分析操作过程
（1）通过DPARSF for Rat Data>“EPI DICOM to NIFTI”与“T1 DICOM to NIFTI”将dcm数据转成nii数据
（2）通过Voxel Size Augmentor将nii数据放大10倍
（3）再通过DPARSF for Rat Data设置参数如下
Slice Number:43
Slice Order:[1:2:43.2:2:42]
Reference Slice:43
其余参数使用Template Parameters模板默认参数（Normalize：Normalize by using T1 image templates）进行分析。并按照标准调整好了原点。
（4）弹出提示如下，选择了OK
（5）最后报错，报错错误信息如下：
%【前面的几行正常运行信息】
Smooth:Sub_001 OK
Smooth:Sub_002 OK
Moving Smoothed Files:Sub_001 OK
Moving Smoothed Files:Sub_002 OK
Resample Masks (E:\zqy-linshi\wq_fmri\DPABI_V6.1_220101\Templates\BrainMask_05_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (E:\zqy-linshi\wq_fmri\DPABI_V6.1_220101\Templates\CsfMask_07_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (E:\zqy-linshi\wq_fmri\DPABI_V6.1_220101\Templates\WhiteMask_09_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
Resample Masks (E:\zqy-linshi\wq_fmri\DPABI_V6.1_220101\Templates\GreyMask_02_91x109x91.img) to the resolution of functional images.
%【错误信息】
错误使用 DPARSFA_run (line 3666)
无法读取文件
'E:\zqy-linshi\wq_fmri\WQdata\analysis-normalizebyepi\RealignParameter\Sub_001'。输
入不能为目录。
出错 DPARSFA>pushbuttonRun_Callback (line 1855)
[Error, Cfg]=DPARSFA_run(handles.Cfg);
出错 gui_mainfcn (line 95)
feval(varargin{:});
出错 DPARSFA (line 30)
gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});
计算 UIControl Callback 时出错。
（6）得到的PicturesForChkNormalization文件夹中图片并没有匹配上，如图：
（7）随后我将Normalize选项改成了选择Normalize by using EPI templates 其余不变再次运行出现了同第（5）步的错误信息。但PicturesForChkNormalization中的图像可以匹配了。如图：
3.问题总结：
（1）请问我们的功能像与结构像Slice Number不一致会不会导致问题？如果会的话，请问有什么方法可以补救？
（2）操作过程中（4）出现的提示No co*T1 images is found是什么意思？要如何改正
（3）操作过程中（6）中PicturesForChkNormalization文件图片的不匹配是因为什么？
（4）操作过程中（5）最后的报错是什么问题？是因为上面一系列的问题导致的吗？还是其他的问题？
您的帮助对我们非常重要！若您需要更多的信息请随时联系我们，期待您的回信！
祝好
祝好
| Attachment | Size |
|---|---|
| （6）中PicturesForChkNormalization结果 | 39.71 KB |
| （7）中PicturesForChkNormalization结果 | 43.7 KB |
| （4）中提到的提示框 | 42.16 KB |
Forums
1. 不会。
1. 不会。
2. 人的T1像会有一个co处理，你点Yes就好。
3. 可能你们T1像的颅外有太多的组织，可以考虑手动剥一下头皮试试。
4. 它找不到文件，你得去倒查一下有可能是什么原因。