dpabi-VBM处理相关问题

Submitted by Yuanyuan on

严老师您好！

1、我已经用dpabi的做了resting state fMRI的预处理，现在准备用dpabi的VBM分析灰质体积，我用一个subject用默认参数试跑了一次（只勾选了Reorient T1*和New segment+DARTEL以及Default mask），出来的结果文件目录和fMRI预处理生成T1ImgNewSegment同一个被试名下的文件相同。我有两个问题：

①请问用dpabi VBM跑出来的T1ImgNewSegment结果和fMRI预处理生成T1ImgNewSegment是否完全相同呢？能否直接用fMRI预处理生成T1ImgNewSegment里面的内容来进行灰质体积分析呢？

②在试跑这个subject的matlab流程里有一项是Running DARTEL: Normalize to MNI space for VBM. Modulated version With smooth kernel [8 8 8]，也就是使用默认模板的时候smooth kernel自动设置为8 8 8，请问意思是这个平滑核是不能调整的吗？

2、在fMRI预处理时需要手动Reorient Fun* 和Reorient T1*，请问这个是需要达到哪种程度呢，冠状面和横断面比较容易调整，但矢状面的水平线是以什么为参考呢？我在一个讲SPM-VBM模块操作的视频里面看到说矢状面的水平线需要通过AC-PC大脑前联合和后联合，如果没有这样调整，对预处理后的数据是否有较大影响呢？

可能是很简单的问题，非常期待您的回复，谢谢！

puyunfashi

Mon, 05/25/2020 - 02:36

Permalink

1. 是一样的

2. 在DPARSFA的界面上有一个调整平滑核的地方，你可以试试在那里调整

3. 不需要太过于纠结，这个是为了排除一些极端情况（脑子翻转/歪到一边/原点偏移前联合过大），一般只要调整到肉眼觉得“差不多了”即可，剩下的算法会自动完成

感谢您的回复！那请问一下fMRI预处理生成T1ImgNewSegment的结果也是经过平滑的吗以及平滑核是否也为8 8 8呢？谢谢

Attachment Size
dpabi_VBM数据处理.png 80.42 KB
Forums
DPABI/DPABISurf/DPARSF