求助VMHC的一个问题

Submitted by liufeng on
大家好,最近我打算用rest试着跑VMHC,出现以下问题:

我直接打开rest的,然后输入数据目录,提示没数据。
我不知道做VHMC需要哪步的数据,我试过这些目录的数据,都提示no data:
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFiltered
FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

应该选择哪一步的数据呢?

谢谢

YAN Chao-Gan

Fri, 09/14/2012 - 16:49

VMHC原理与功能连接(seed based correlation)差不多。所以两者应该用相似的预处理。即FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved

如果你是选择上面的总文件夹的话,需要点右键“Add recursively all sub-folders of a directory”来添加。

Chen0075

Fri, 02/22/2013 - 16:33

In reply to by YAN Chao-Gan

 您好!
我对VMHC也感兴趣,读了几篇文献发现都是基于FSL/Alfani做的,我们的新版Deparsf是否能够全程跑完。
1)跑到FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFilteredCovremoved,是否表示预处理完成了。接下来再选择“Normalize  to symmetric template” 和“VMHC”即可?
2)新版里“Normalize derivative” 和“smooth derivative” 是用来干什么的,要选择吗?
3)文献里VMHC的统计比较似乎也和我们平时用的不一样,能够用rest里面的FDR/Montcarlo矫正吗
谢谢!

YAN Chao-Gan

Sun, 02/24/2013 - 08:49

In reply to by Chen0075

Hi,

1. 预处理步骤是完成了,这是一种比较常见的方式,当然争议还是存在。如果你是用basic edition处理的,然后再advanced edition做normalize to symmetric template,不一定能正确地找到文件,但你可以试试。

2. normalize derivative是在原始空间计算之后,把计算出来的指标(如ALFF)配到MNI空间。smooth同理。

3. 我认为在一侧MASK里面是可以的。
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