Submitted by liwenfu on Mon, 04/23/2012 - 02:28 我的静息态实验有两个组,A和B,先给A、B组在REST软件中分别做了一个单样本T检验,此时没有选择MASK,然后用Slice Viewer分别打开这两个组的单样本T检验结果,使用Alphasim(0.05)矫正,Cluster个数选择的是324,我现在为了得到双样本T检验的MASK,是将正负激活的Clusters都保存下来还是只保存Only+啊,这两种有没有区别啊,我计算MASK时的表达式是“(i1>0+i2>0)>0”. 双样本T检验MASK 首先,静息态没有激活,没有“激”,就不存在“激活”,我们称为之活动。 单样本T检验结果校正时的voxel数324从何而来?是否Slice Viewer中给出的? 双样本T检验为什么要用MASK?你想看什么?用什么MASK取决于你想要看什么。 从某一结果中保存MASK时正负都保留和只保留正有没有区别也取决于你使用的结果,如果结果中有正有负,当然跟只保留正就是有区别的。 软件是我们实现目标的手段,我们第一步应该先明确目标。 Log in or register to post comments 谢谢老师的回答 我实验的目的就是考察高低创造性被试的静息状态是否有差异,高低创造性是用量表测得的,我准备用ALFF的指标,先做两组的单样本T检验,然后再做双样本T检验。 单样本T检验结果矫正是在Slice Viewer中进行的,由于我的平滑核使用的是[8 8 8 ],我设置的Alphasim矫正的p值是.05,然后我选择的rmm是4,所有个数是324 我看视频教程里面说,可以用两组的单样本T检验矫正后的图做并集做为双样本T检验的MASK, Log in or register to post comments 双样本T检验MASk 可以使用两组单样本并集作双样本的MASK. 如果你想考察高低创造性被试ALFF的差异,保存MASK时建议正负都保留,最大限度观测到差异. 制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己. Log in or register to post comments 我是用SPM中的Image Calculator制作的MASK 我将两个组的单样本T检验在Slice Viewer中调整好阈值,用Alphasim矫正后,点击save clusters,保存后,用SPM中的Image Calculator制作的MASK,首先选择刚刚保存的两组的单样本T检验的图,然后表达式是“(i1>0+i2>0)>0”,得到一个MASK,然后将这个MASK用到双样本T检验中。不知道这种方法行不行,和你说的这种有什么差异,谢谢。 Log in or register to post comments Re 注意一下有这样的一个concern: http://www.restfmri.net/forum/node/764#comment-1235 如果你不关心在任意一组都不显著的体素(当然有时候两组都不显著的体素也会存在组间差异,并且这种差异有可能是有意义的!): 也许双样本T检验的校正还是应该在全脑范围内校正,但报告和显示结果在one sample t-test 的MASK内。 Log in or register to post comments 这里的意思是不是就是说双样本T检验不选mask 是不是说我如果只关注两组差异的地方,在做双样本T检验的时候就可以不用选择MASK,只是在报告和显示结果的时候再使用单样本T检验的MASK?这个功能是不是用Imge Calculator进行,表达式应该怎么写?谢谢老师 Log in or register to post comments Forums Discuss Log in or register to post comments
双样本T检验MASK 首先,静息态没有激活,没有“激”,就不存在“激活”,我们称为之活动。 单样本T检验结果校正时的voxel数324从何而来?是否Slice Viewer中给出的? 双样本T检验为什么要用MASK?你想看什么?用什么MASK取决于你想要看什么。 从某一结果中保存MASK时正负都保留和只保留正有没有区别也取决于你使用的结果,如果结果中有正有负,当然跟只保留正就是有区别的。 软件是我们实现目标的手段,我们第一步应该先明确目标。 Log in or register to post comments
谢谢老师的回答 我实验的目的就是考察高低创造性被试的静息状态是否有差异,高低创造性是用量表测得的,我准备用ALFF的指标,先做两组的单样本T检验,然后再做双样本T检验。 单样本T检验结果矫正是在Slice Viewer中进行的,由于我的平滑核使用的是[8 8 8 ],我设置的Alphasim矫正的p值是.05,然后我选择的rmm是4,所有个数是324 我看视频教程里面说,可以用两组的单样本T检验矫正后的图做并集做为双样本T检验的MASK, Log in or register to post comments
双样本T检验MASk 可以使用两组单样本并集作双样本的MASK. 如果你想考察高低创造性被试ALFF的差异,保存MASK时建议正负都保留,最大限度观测到差异. 制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己. Log in or register to post comments
我是用SPM中的Image Calculator制作的MASK 我将两个组的单样本T检验在Slice Viewer中调整好阈值,用Alphasim矫正后,点击save clusters,保存后,用SPM中的Image Calculator制作的MASK,首先选择刚刚保存的两组的单样本T检验的图,然后表达式是“(i1>0+i2>0)>0”,得到一个MASK,然后将这个MASK用到双样本T检验中。不知道这种方法行不行,和你说的这种有什么差异,谢谢。 Log in or register to post comments
Re 注意一下有这样的一个concern: http://www.restfmri.net/forum/node/764#comment-1235 如果你不关心在任意一组都不显著的体素(当然有时候两组都不显著的体素也会存在组间差异,并且这种差异有可能是有意义的!): 也许双样本T检验的校正还是应该在全脑范围内校正,但报告和显示结果在one sample t-test 的MASK内。 Log in or register to post comments
这里的意思是不是就是说双样本T检验不选mask 是不是说我如果只关注两组差异的地方,在做双样本T检验的时候就可以不用选择MASK,只是在报告和显示结果的时候再使用单样本T检验的MASK?这个功能是不是用Imge Calculator进行,表达式应该怎么写?谢谢老师 Log in or register to post comments
双样本T检验MASK
单样本T检验结果校正时的voxel数324从何而来?是否Slice Viewer中给出的?
双样本T检验为什么要用MASK?你想看什么?用什么MASK取决于你想要看什么。
从某一结果中保存MASK时正负都保留和只保留正有没有区别也取决于你使用的结果,如果结果中有正有负,当然跟只保留正就是有区别的。
软件是我们实现目标的手段,我们第一步应该先明确目标。
谢谢老师的回答
单样本T检验结果矫正是在Slice Viewer中进行的,由于我的平滑核使用的是[8 8 8 ],我设置的Alphasim矫正的p值是.05,然后我选择的rmm是4,所有个数是324
我看视频教程里面说,可以用两组的单样本T检验矫正后的图做并集做为双样本T检验的MASK,
双样本T检验MASk
如果你想考察高低创造性被试ALFF的差异,保存MASK时建议正负都保留,最大限度观测到差异.
制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己.
我是用SPM中的Image Calculator制作的MASK
Re
如果你不关心在任意一组都不显著的体素(当然有时候两组都不显著的体素也会存在组间差异,并且这种差异有可能是有意义的!):
也许双样本T检验的校正还是应该在全脑范围内校正,但报告和显示结果在one sample t-test 的MASK内。
这里的意思是不是就是说双样本T检验不选mask
是不是说我如果只关注两组差异的地方,在做双样本T检验的时候就可以不用选择MASK,只是在报告和显示结果的时候再使用单样本T检验的MASK?这个功能是不是用Imge Calculator进行,表达式应该怎么写?谢谢老师