P/N的校正是不是就是Bonferroni校正?
我的ANOVA后来是参考了你们那篇2011年Human Brain Mapping上的文章(就是ALFF在MCI、AD中的应用):把Post hoc的范围限制在ANOVA后存活的脑区内;但是这种做法似乎reviewer觉得并不是最好的,他认为:Was a random effects model fit and contrasts estimated for determining whether pairs of groups differed (preferred method), or were two-sample t-tests for all pairwise comparisons performed? If the latter, note that contrasts from the ANOVA model should be used。
你说的Sidak校正,是否就是reviewer建议的做法(之一),REST可以做吗?
谢谢!
我也认为,审稿人的这句话太含糊,是否有上下文供进一步猜测?或者,你直接回信,请editor问一下审稿人,这句话到底是什么意思,显然不清楚。关于ANOVA之后的post hoc analysis的校正问题,似乎脑影像学软件都没提供这个功能。我个人认为,多重比较校正,不必过分关心,讲清楚就可以了,对于相对较大的p值,下结论时不要太绝对就是了。
十分感谢各位老师的细心解答!
我想确认一下P/N的校正是不是就是Bonferroni校正,我在你们另一篇文章(Xia Wu;2011)中看到这个表达:
To correct for the possible inflated type-I errors, multiple comparisons were corrected using Bonferroni at P = 0.05.
是不是就是对该校正的描述(为了写成英文回答reviewer)。
谢谢!
张老师,你好,能回答一下么:
P/N的校正是不是就是Bonferroni校正?我在你们另一篇文章(Xia Wu;2011)中看到这个表达:
To correct for the possible inflated type-I errors, multiple comparisons were corrected using Bonferroni at P = 0.05.
是不是就是对该校正的描述?
Re
对相关在哪儿做的问题,我同意超赣的意见。 但是现在也有很多
对相关在哪儿做的问题,我同意超赣的意见。
但是现在也有很多文章,而且也有好文章,也可以“独立”地在全脑范围内做相关。
怎么解释结果呢?
其实,该问题在ANOVA的分析中,显示的更“彻底”,因为我们做post hoc组间分析时,往往是把范围设定在ANOVA分析后的significant脑区内;前一段时间一个专业的statistical reviewer就提出说把correlation analysis 扩张到“非异常的脑区”,很明显会降低statistical power!
另外,顺便请教一下:我做了组间比较得到4个clusters(并用REST提出其中的FC值), 同时我有3个行为学量表,这样我做相关分析是就要做12次,请问这里的多次比较校正应该怎么做呢,要用什么软件,什么方法,能否给一个比较详细的操作步骤!谢谢!
我个人认为,在单样本t检验mask里看相关,或者是更全面地
我个人认为,在单样本t检验mask里看相关,或者是更全面地在全脑看相关,没有人非说这是错的。
一般可以不用校正,校正我一般用严格的p/N (N为比较次数,p为校正后阈值)。
ANOVA分析中的posthoc分析可以采用Sidak校正。不知能否应用在你的研究中。
校正
我的ANOVA后来是参考了你们那篇2011年Human Brain Mapping上的文章(就是ALFF在MCI、AD中的应用):把Post hoc的范围限制在ANOVA后存活的脑区内;但是这种做法似乎reviewer觉得并不是最好的,他认为:Was a random effects model fit and contrasts estimated for determining whether pairs of groups differed (preferred method), or were two-sample t-tests for all pairwise comparisons performed? If the latter, note that contrasts from the ANOVA model should be used。
你说的Sidak校正,是否就是reviewer建议的做法(之一),REST可以做吗?
谢谢!
审稿人说的那段话我没有看太理解,好像说的是ANOVA,或者
校正是在统计完了以后进行的。
Sidak的方法你可以google一下,目前REST没有。Sidak比Bonforroni校正略宽松。它实际上已经考虑到了你的假设:就是ANOVA做出来显著的地方,一定是更加可能出现pairwise difference的。
Re:相关问题
谢谢各位老师的解答!!!
我想确认一下P/N的校正是不是就是Bonferroni校正,我在你们另一篇文章(Xia Wu;2011)中看到这个表达:
To correct for the possible inflated type-I errors, multiple comparisons were corrected using Bonferroni at P = 0.05.
是不是就是对该校正的描述(为了写成英文回答reviewer)。
谢谢!
能回答一下么
P/N的校正是不是就是Bonferroni校正?我在你们另一篇文章(Xia Wu;2011)中看到这个表达:
To correct for the possible inflated type-I errors, multiple comparisons were corrected using Bonferroni at P = 0.05.
是不是就是对该校正的描述?
对的