单样本T检验出问题

Submitted by stevenlee697 on
又来麻烦各位老师了。 我做了一下正常对照组的FC单样本T检验,发现正连接图激活面积很大,包括了默认网络脑区,不知道是哪出了问题,是不是方法上有问题?谢谢。 (我选了后扣带回的直径6MM小球作为种子区,VOXEL WISE,去除四个协变量,单样本T检验后在rest SLICE VIEWER中处理,ALPHASIM校正,RMM=5,P=0.05) XJVIEWER显示结果只有一个大CLUSTER,有一万四千多VOXELS(共28个CLUSTER)其它是几或几十,大部分是十以下。 附件中有图

谢谢臧老师,我用GE自带的VIEWER软件查看了所有被试(24个)的图像、时间序列,没有发现问题。请问臧老师出现此问题还会是哪出了毛病??谢谢。

去除四个协变量,是指什么?团块看起来是有点大。 如果没有去global,全脑的正连接都会很强。

stevenlee697

Sun, 02/19/2012 - 12:30

In reply to by YAN Chao-Gan

我是严格按照严老师视频讲解一步一步操作的。DPARSF中,“去除头动、全脑、白质和脑脊液四个协变量后”,选取SEED,后点FC,运算的。前面的步骤也没问题。这是怎么回事呢??

从图上看,的确看不到负相关。如果加了全脑平均时间序列,负相关总是应该能看到的,而这个图似乎只有one-tail或one-sided的结果(只显示正)。至于cluster 体积太大的问题,用较小的p值即可。

谢谢臧老师,您说的对,我点了只显示正连接按钮。不过,在原来参数不变的情况下,我缩小了P值,P=0.01、P=0.001,正连接图变化不大,如“单样本T检验出问题2”附件内图所示(第一、二幅为P=0.01,第三、四幅为P=0.001),这是为什么?另外,原来用FDR可以校正,现在不知道为什么不行了,显示FDR only take effects on the statistical map,这又是为什么?谢谢。(这里不让传图,只能再开一个TOPIC“单样本T检验出问题2”)

我的观点:图总体看起来pattern还是有的,只是相对较怪一些。如果不校正的话,选P<0.001正负都显示一下,看看pattern? “FDR only take effects on the statistical map”,表明你的图像不是用REST或SPM做的统计,里面没有自由度信息,请再检查或重做一下。

stevenlee697

Mon, 02/27/2012 - 14:46

In reply to by YAN Chao-Gan

严老师好,感谢你的帮助。 我重新做了一下正常组的ONE SAMPLE T TEST,FDR就可以做了,有结果。 我在不校正的情况下,做了P<0.001,有结果。 又直接在SLICE VIEWER中将T值分别改成100、150、250后,发现PATTERN有了样子,您看看。这是怎么回事,是不是计算的问题??谢谢。 结果图在“单样本T检验出问题3”中, 第一、二图为P<0.001 第三、四图为FDR P<0.05 第五、六图为T=100 第七、八图为T=150 第九、十图为T=250

总的来说,相对很强。 你有多少被试? 另外,建议试试别的dataset对比一下。
Forums