Submitted by flyinghonghong on Mon, 01/21/2013 - 09:01 各位老师好: 我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件,格式是”.nii”,然后用Slice View可以读取,也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值,请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢???? Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 严老师可能更清楚如何得到次大和第三大的peak值。 如果我来做的话,我会用spm来做paired t test,然后用spm来看结果,或者用xjview来看结果(基于spm的result table) Log in or register to post comments Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~ Log in or register to post comments Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? :) 我也赞成这是目前最方便的方法。 Log in or register to post comments Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? O(∩_∩)O~谢谢超赣师兄~~~ Log in or register to post comments Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。 Log in or register to post comments Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 恩,非常感谢藏老师 Log in or register to post comments Forums Discuss Log in or register to post comments
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 严老师可能更清楚如何得到次大和第三大的peak值。 如果我来做的话,我会用spm来做paired t test,然后用spm来看结果,或者用xjview来看结果(基于spm的result table) Log in or register to post comments
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~ Log in or register to post comments
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢? 我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。 Log in or register to post comments
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
如果我来做的话,我会用spm来做paired t test,然后用spm来看结果,或者用xjview来看结果(基于spm的result table)
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
O(∩_∩)O~谢谢超赣师兄~~~
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。
Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
恩,非常感谢藏老师