rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?

Submitted by flyinghonghong on
各位老师好:
     我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件,格式是”.nii”,然后用Slice View可以读取,也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值,请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢????

非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~

 我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。

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