关于dpabi中viewer

Submitted by lizf111 on

严老师：

您好！我做了三组数据N、L、R，用dpabi中的statitical analysis做Two-sample T-test后，生成的L_R的T2.nii在viewer中可以打开，但N_L和N_R的T2.nii在viewer中却打不开，报错信息如下，急等指教，谢谢!

Reading images from "C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_002.nii" etc.

 Image Files in Group 1:
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_002.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_003.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_004.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_008.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_009.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_014.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_017.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_018.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_021.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_022.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_025.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_026.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_030.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_039.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_042.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_043.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_044.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_049.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_051.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_052.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_053.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_054.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_055.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_056.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_057.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_059.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_060.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_062.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_063.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_064.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_066.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_067.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_068.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_069.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_073.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\N\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_074.nii

Reading images from "C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_003.nii" etc.

 Image Files in Group 2:
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_003.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_006.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_009.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_010.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_011.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_014.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_016.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_017.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_021.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_027.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_037.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_045.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_047.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_048.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_056.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_057.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_059.nii
 C:\Users\Think\Desktop\results\ALFF\L\swzALFFMap\swzALFFMap_sub_063.nii

 Regression Calculating...
.........................................................................................................................DLH NaN voxels^-3 before correcting for temporal DOF

FWHMx = NaN voxels
FWHMy = NaN voxels
FWHMz = NaN voxels
FWHMx = NaN mm
FWHMy = NaN mm
FWHMz = NaN mm
DLH = NaN
VOLUME = 271633
RESELS = NaN

 Regression Calculation finished.

 Two Sample T Test Calculation finished.
??? Error using ==> ones
NaN and Inf not allowed.

Error in ==> repmat at 84
            B = A(ones(siz(1), 1), :);

Error in ==> y_AdjustColorMap at 30
    NewColorMap(Begin:End,:) = repmat(OriginalColorMap(iColor,:),[Segment 1]);

Error in ==> w_OverlayList>RedrawOverlay at 1348
ColorMap = y_AdjustColorMap(ColorMap,...

Error in ==> w_OverlayList>Accept_Callback at 1416
            OverlayHeader=RedrawOverlay(OverlayHeader, handles.MainFig);

Error in ==> gui_mainfcn at 96
        feval(varargin{:});

Error in ==> w_OverlayList at 42
    gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});

Error in ==> @(hObject,eventdata)w_OverlayList('Accept_Callback',hObject,eventdata,guidata(hObject))

 
??? Error using ==> waitfor
Error while evaluating uicontrol Callback

YAN Chao-Gan

Thu, 09/25/2014 - 21:54

Permalink

Hi,

Seems there is no results in your analysis, thus DPABI Viewer gives an error.

Best,

Chao-Gan

lizf111

Fri, 09/26/2014 - 01:12

Permalink

严老师：

您好！非常需要您的帮助。

1、 swzReHomap是不是swmReHomap做了z变换之后的结果？

2、我虽然用ReHo结果中的swzReHomap做出的N_L及N_R的Two Sample T test结果在viewer中打不开，但我用ReHo结果中的swmReHomap做出的N_L及N_R的Two Sample T test结果在viewer却可以打开。

2、我用ALFF结果中的swzALFFmap和swmALFFmap做出的N_L及N_R的Two Sample T test结果在viewer中都打不开，但是swzALFFmap和swmALFFmap做出的L_R的Two Sample T test结果在viewer中都可以打开。

(注：N为正常组，L为左侧组，R为右侧组。三组数据跑的参数完全一样。）

另外还有上次一个问题：用dpabi中的Viewer显示一个two-sample-t -test的结果时,Alfasim怎么做？

（1）Mask File如果无特殊的mask，是否都选BrainMask_05_61×73×61？

（2）点了Estimate……之后，Voxel p value 怎么填？之后点compute ,Matlab计算，Iteration 1000后怎么做呢？

            谢谢！

1. 不是。请参阅：

A Comprehensive Assessment of Regional Variation in the Impact of Head Micromovements on Functional Connectomics

CG Yan, B Cheung, C Kelly, S Colcombe, RC Craddock, AD Martino, Q Li, ...
NeuroImage

 

Standardizing the intrinsic brain: Towards robust measurement of inter-individual variation in 1000 functional connectomes

CG Yan, RC Craddock, XN Zuo, YF Zang, MP Milham
Neuroimage 80, 246-262
 
2. ReHo结果中的swzReHomap做出的N_L及N_R的Two Sample T test结果在viewer中打不开
--因为swzReHomap做出的没结果。
3. 见http://rfmri.org/Course
4. 可以。
5. 看文献。0.01， 0.0214或0.05都有人填。
 
超赣
 

 

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