请教如何计算各脑区的体积和密度信息

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论坛版主: 你们好! 不好意思,打扰你们了,我想请教各位一个如何提取各个脑区的体积信息。结构的数据我已经有了,用VBM处理过数据,但我感兴趣的是每个脑区体积的信息,而不是总体灰质或白质的情况,比如我想提取AAL模板中第58个脑区的体积数据 ,不知道有没能软件能实现这个功能。 谢谢!!

YAN Chao-Gan

Mon, 05/30/2011 - 13:50

REST->Utilities->Extract ROI signals。 视频里面有介绍。

06170323

Tue, 05/31/2011 - 01:43

In reply to by YAN Chao-Gan

谢谢你的回答 我还有个疑问,rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时,我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值,而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧,如何解决这一问题呢? 打扰了,抱歉!

06170323

Tue, 05/31/2011 - 01:44

In reply to by YAN Chao-Gan

谢谢你的回答 我还有个疑问,rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时,我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值,而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧,如何解决这一问题呢? 打扰了,抱歉!

鉴于你的需要,你应该是用REST Extract ROI Signals中"Multiple label values in a single mask"选项,才能一下提取多个AAL脑区的值。 如果是这种情况,打开rest_ExtractROITC_MultiValues.m,将第53行从 theROITimeCourses(t) =mean(theTimePoint); 改为 theROITimeCourses(t) =sum(theTimePoint); 即可。
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